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BLUP法估計育種值

關於遺傳評定和育種值

遺傳評定的概念評定個體單個或多個性狀的遺傳價值預測後裔在特定環境下的表現科學、準確地選擇種畜的方法選種、選配的主要依據育種工作的中心任務獲得優良後代

遺傳評定的方法使要評估的個體在相同的環境下進行比較將要評估的個體或其親屬（同胞和後裔）集中在相對標準化的環境下進行性能測定性能測定站：雞（選擇指數法）用統計學方法對環境差異進行校正場內測定估計育種值（BLUP法）

測定站測定和場內測定的定義據測定的場所進行劃分測定站測定（stationtest）：將待測畜群集中在專門的性能測定站、並在一定時間內進行性能測定場內測定（on-farmtest）:直接在各個畜牧場內進行的性能測定

測定站測定和場內測定的優缺點測定站測定的優點：測定結果具有客觀性、中立性被測畜群個體間的差異主要是遺傳差異：相同的環境條件、測量工具和測量人員等可以對需要特殊測量設備或較高技術要求的性狀進行測量：eg.體細胞數測定、氟烷敏感基因測定等

測定站測定和場內測定的優缺點測定站測定的缺點：測定成本較高：運輸費、檢測費等測定規模有限：選擇強度小容易傳播疾病：不易對傳染病進行控制遺傳－環境互作：測定結果與場內測定有出入場內測定的優缺點：剛好與測定站測定相反。若場間個體缺乏遺傳聯繫時，不能跨場進行遺傳評定

測定站測定和場內測定的應用情況測定站測定：上世紀60-70年代，雞、豬、牛等性能測定多用目前主要用於需要特殊設備才能測定的性狀。eg.胴體品質、體細胞數場內測定：上世紀80年代以後，已成為世界各國性能測定的主要方式BLUP方法的廣泛應用：校正環境的影響人工授精的普及：不同畜場個體間建立了遺傳聯繫

受遺傳和環境的共同影響受多個基因的作用一般不能對單個基因進行分析絕大多數重要經濟性狀都是數量性狀數量性狀的基本特徵

表型值（P）=遺傳效應（G）+環境效應（E） =加性遺傳效應（A）+顯性效應（D）+上位效應（I）+ 系統環境效應（ES）+隨機環境效應（ER） 加性遺傳效應：可以由親代傳遞給後代的遺傳組分表型值的效應分剖

育种值的概念個體作為親本的種用價值（對後代的遺傳貢獻）

決定性狀所有基因的平均效應總和衡量個體遺傳素質的最主要指標不能被觀測，只能根據表觀資訊（表型值）估計

育種值的概念平均效應（α），遺傳加性效應（A）一個個體隨機交配的後代，其平均表型值與群體均值之差等於育種值的一半

育種值的估計育種值估計方法：利用個體間的相似性，評定個體的遺傳水準育種值估計方法的效率，直接關係到是否更真實地預測個體的遺傳素質育種值估計方法的效率，也關係到群體的遺傳進展和育種效益問題

利用各種可利用的表型資訊和特定的統計學方法，將加性遺傳效應從表型值中剖分出來基因?+表型值?資料庫?統計分析?估計育種值環境?估計育種值的精確性取決於可利用的資訊量統計分析方法育種值估計方法

利用所有親屬的資訊可利用的親屬的表型資訊直接的資訊來源：本身，父母，後裔間接的資訊來源：祖父母，全同胞，半同胞，叔叔，嬸嬸，……… 個體1/41/41/41/41/21/21/21/41/2祖父祖母外祖父外祖母父親母親同胞半同胞後裔

關於BLUP育種值估計方法BLUP：結合了選擇指數法和最小二乘法的優點

選擇指數法的基本要點不存在系統環境效應個體隨機來自同一總體各遺傳參數事先已估計出來當滿足三個前提時，使用選擇指數法，可得到育種值的最佳線性預測（BLP）在家畜育種實踐中使用選擇指數的重要原則是滿足第二個前提

最小二乘法(LS)的基本要點1934年，Yates提出；1960年，Harvey引入到畜牧統計中可估計影響觀察值的各種固定效應可將觀察值中的固定效應校正出去對於不平衡數據可獲得最佳線性無偏估計值（BLUE）利用最小二乘法（LeastSquares,LS）校正後的觀察值稱最小二乘均數

BLUP產生和發展的背景選擇指數法理論上的缺陷結合最小二乘方法的優點1949年C.R.Henderson理論上提出BLUP由於計算技術的滯後，限制了應用20世紀70年代中期電腦技術的發展，為BLUP在育種中應用提供了可能首先在奶牛育種中，而後在豬育種中應用我國先後在奶牛和豬育種中得到應用BLUP電腦程式的研製

BLUP=最佳線性無偏預測 （BestLinearUnbiasedPrediction)最佳-估計誤差最小，估計育種值與真實育種值的相關最大線性-估計是基於線性模型（估計值與觀察值呈線性關係）無偏-估計