聚类分析简单例子.ppt

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第31页,共38页,星期六,2024年,5月三、类间距离的统一性上述八种系统聚类法的步骤完全一样,只是距离的递推公式不同。兰斯(Lance)和威廉姆斯(Williams)于1967年给出了一个统一的公式。(5.28) 其中ap、aq、?、?是参数,不同的系统聚类法,它们取不 同的数,详见表5.8。这里应该注意,不同的聚类方法结果不一定完全相同,一般只是大致相似。如果有很大的差异,则应该仔细考查,找到问题所在;另外,可将聚类结果与实际问题对照,看哪一个结果更符合经验。第32页,共38页,星期六,2024年,5月表5.8系统聚类法参数表第33页,共38页,星期六,2024年,5月【例5.3】假定我们对A、B、C、D四个样品分别测量两个变量和得到结果见表5.9。 试将以上的样品聚成两类。表5.9样品测量结果动态聚类法第34页,共38页,星期六,2024年,5月 第一步:按要求取K=2,为了实施均值法聚类,我们将这些样品随意分成两类,比如(A、B)和(C、D),然后计算这两个聚类的中心坐标,见表5.10所示。 表5.10中的中心坐标是通过原始数据计算得来的,比如(A、B)类的,等等。表5.10中心坐标第35页,共38页,星期六,2024年,5月 第二步:计算某个样品到各类中心的欧氏平方距离,然后将该样品分配给最近的一类。对于样品有变动的类,重新计算它们的中心坐标,为下一步聚类做准备。先计算A到两个类的平方距离: 由于A到(A、B)的距离小于到(C、D)的距离,因此A不用重新分配。计算B到两类的平方距离:第36页,共38页,星期六,2024年,5月由于B到(A、B)的距离大于到(C、D)的距离,因此B要分配给(C、D)类,得到新的聚类是(A)和(B、C、D)。更新中心坐标如表5.11所示。表5.11更新后的中心坐标第37页,共38页,星期六,2024年,5月感谢大家观看第38页,共38页,星期六,2024年,5月关于聚类分析简单例子二、类间距离与系统聚类法在进行系统聚类之前,我们首先要定义类与类之间的距离,由类间距离定义的不同产生了不同的系统聚类法。常用的类间距离定义有8种之多,与之相应的系统聚类法也有8种,分别为最短距离法、最长距离法、中间距离法、重心法、类平均法、可变类平均法、可变法和离差平方和法。它们的归类步骤基本上是一致的,主要差异是类间距离的计算方法不同。以下用dij表示样品Xi与Xj之间距离,用Dij表示类Gi与Gj 之间的距离。第2页,共38页,星期六,2024年,5月 1.最短距离法 定义类Gi与Gj之间的距离为两类最近样品的距离,即为 (5.11) 设Gk类与合并成一个新类记为Gr,则任一类与的距离为 (5.12)第3页,共38页,星期六,2024年,5月最短距离法进行聚类分析的步骤如下: (1)定义样品之间距离,计算样品的两两距离,得一距离阵记为D(0),开始每个样品自成一类,显然这时Dij=dij。 (2)找出距离最小元素,设为Dpq,则将Gp和Gq合并成一个 新类,记为Gr,即Gr={Gp,Gq}。 (3)按(5.12)计算新类与其它类的距离。(4)重复(2)、(3)两步,直到所有元素。并成一类为止。如果某一步距离最小的元素不止一个,则对应这些最小元素的类可以同时合并。第4页,共38页,星期六,2024年,5月【例5.1】设有六个样品,每个只测量一个指标,分别是1,2,5,7,9,10,试用最短距离法将它们分类。 (1)样品采用绝对值距离,计算样品间的距离阵D(0),见表5.1表5.

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