分子生物学第6章.ppt

核糖体包括至少5个活性中心:mRNA结合部位A位结合或接受肽基tRNA的部位P位形成肽键的部位（转肽酶中心）四、蛋白质前体（新生肽）的加工

由核糖体释放的新生肽链并不是一个完整的、有生物学功能的蛋白质分子，与RNA一样，必须经过后加工，才具有生物学活性，包括形成高级结构、与其他亚基缔合及其他的共价修饰。1、N端fMet(原核)或Met(真核)的切除去甲酰化酶水解蛋白质N端的甲酰基第六节蛋白质生物合成

与蛋白质组学蛋白质组学～是研究基因产物即蛋白质表达水平、氨基酸序列、翻译后的加工和蛋白质的相互作用，在蛋白质水平上了解细胞的各项功能、各种生理生化过程及疾病的病理学过程。一、蛋白质组学产生的科学背景生命科学巳实质性跨入了后基因组时代，研究重心已开始从揭示生命的所有遗传信息转移到分子整体水平对功能的研究上。第一个标志：功能基因组学第二个标志：蛋白质组学蛋白质组～指基因组表达的全部蛋白质及其存在方式。蛋白质组学：阐明生物体全部蛋白质的表达模式及功能模式，其内容包括鉴定蛋白质的表达、存在方式(修饰形式)、结构、功能和相互作用等。二、蛋白质组学研究的内容从两方面进行：①技术体系：即蛋白质组样品的制备、组分的分析鉴定以及蛋白质相互作用网络等方面的技术研究；②信息学体系：包括建立蛋白质组数据库、相关软件的开发应用以及生物信息学。基本分析步骤:(一)蛋白质的分离：核心技术：双向聚丙烯酰胺凝胶电泳技术(2D—PAGE)(二)蛋白质的鉴定：核心技术：质谱分析技术(三)蛋白质组学研究内容蛋白质的表达模式：鉴定蛋白质，建立蛋白质图谱和数据库。蛋白质的功能模式：发现和鉴定特定功能的蛋白质。三、蛋白质组学的研究进展一种：细胞或组织的全部蛋白质～整个蛋白质组；另一种：一个特定的生物学问题或机制的相关全部蛋白质。蛋白质组学已经开始从建立数据库走向解决生命科学的重大问题，成为研究生物学问题或机制的强有力手段。思考题:1、什么是遗传密码？遗传密码具有哪些特点？2、tRNA有什么功能？它有哪些类型？3、什么是核糖体？原核生物和真核生物的核糖体组成有什么不同？4、蛋白质的生物合成包括哪些过程？这一过程中有哪些蛋白因子参与？5、蛋白质前体的加工有哪些方式？6、信号肽假说的主要内容是什么？简述蛋白质跨膜运转的运输过程？7、什么是分子伴侣？它有哪些功能？8、什么是蛋白质组学？它的主要研究内容是什么？铁结合调节蛋白缺铁有铁翻译起始因子(eIF2)的调控蛋白质组研究的基本技术路线蛋白质样品的制备双向电泳图像分析转印至膜上的蛋白凝胶中的蛋白溶液中的蛋白混合肽蛋白质质量N端测序肽序列质谱数据肽指纹图数据搜索新的或已知蛋白蛋白转录后修饰的鉴定蛋白质双向聚丙烯酰胺凝胶电泳图谱实验方法完整蛋白质（如凝胶分离或色谱纯化蛋白质）肽混合物质谱测定肽质量（MALDI-MS,ESI-MS)选择肽段裂解PSD-MALDI-MS,ESI-MS/MS)计算方法蛋白质序列数据库（＋核酸序列翻译数据库）肽质量检索未解析碎片离子检索酶切质谱鉴定蛋白质的策略第四节蛋白质生物合成的机制起始（Initiation）延伸（elongation）终止与释放（terminationrelease）氨基酸的活化（activationofaminoacids）1、与蛋白质合成相关的重要蛋白因子1）起始因子（Initiatorfactor，IF）一类协助形成蛋白质合成起始复合物的蛋白质一、与蛋白质合成相关的重要蛋白因子EcoliIF-1提高IF-2与IF-3的活性GTP存在，使Met-tRNA与30S亚基结合30S亚基结合到mRNA起始位置IF-3αIF-3βIF-2aIF-2b真核生物起始因子（Eucaryoticinitiatorfactor）eIF-2稳定40S起始复合物促使40S起始复合物的形成依赖RNA的ATPase,促使mRNA结合核糖体激活eIF-4A和eIF-4F，促进mRNA结合参与40S起始复合物的形成促进第一个肽键形成识别并结合mRNA的帽子结构帽子识别促进40S与60S亚基结合，释放起始因子与Met-tRNAMet结合有关，需GTPAUG存在下与Met-tRNAMet结合40S亚基促进eIF-2-GDP转变成eIF-2-GTP核糖体解离，结合60S亚基eIF-1eIF-6eIF-5eIF-4FeIF-4EeIF-4DeIF-4CeIF-4BeIF-4AeIF-3eIF-2BeIF-2A2