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中医药领域代谢组学整合网络药理学研究概况

【摘要】代谢组学技术以生物体内小分子代谢物为研究对象，通过现代技术从

整体上解析生物体内的动态代谢变化，多维度阐释其病理生理体系。而网络药理

学则从系统上探索药物与疾病的相关性。将网络药理学与代谢组学相结合开展研

究，符合中医药系统性和整体性的思维模式。目前，二者的整合技术在中药单药、

药对、复方药效物质基础和机制、中药毒性机制、中药质量及成分、中药炮制机

制等研究中均有一定应用，可实现从差异代谢物挖掘中药复杂体系有效成分，进

而寻找中药核心作用基因和靶标蛋白，揭示中药防治疾病的生物途径，具有快速、

有效辨识中药药效和物质基础和阐明其作用机制的优势。但二者联用时缺乏对外

源性成分及其相关靶点的获取，易存在假阳性结果，整体水平单一且局限性大，

故需进一步思考并加以完善。

【关键词】中医药学；代谢组学；网络药理学；应用概况；综述

近年来，组学技术在中医药研究中的应用越来越多。其中，代谢组学是继蛋

白质组学、转录组学后发展起来的新兴组学，处于基因调控网络和蛋白质作用网

络下游，提供生物学终端信息，更接近表型，有助于探究生理变化机制，其研究

对象是机体内分子量较小的内源性代谢物，如糖类、氨基酸、脂质和有机酸等，

通过分析机体在不同干预条件下的代谢物，从中找出与干扰相关的差异代谢物，

并结合生物信息学阐明代谢通路［1-2］。网络药理学在系统生物学与计算机技

术高速发展基础上逐渐成熟［3-4］。癌症、血液系统疾病、糖尿病等复杂疾病

发生发展与机体调控网络中多个基因和信号通路密不可分，若仅依靠单一作用靶

点难以达到良好疗效［5］，而网络药理学可利用与疾病相关的生物网络评估多

靶点药物作用机制。

当前，对中药化学成分与有效成分的错位认识、提取物越纯活性越弱甚至无

效、临床有效但药效物质不明、化合物体外有效但生物利用度和成药性差、药效

/毒效叠加方式和协同/拮抗机制不清，以及中药药效物质体内发生发展过程未明

确等均是制约中医药发展的重要问题［6］，需通过多种技术联合提高研究质量，

达成更多研究目标。因此，本文综述代谢组学与网络药理学的整合技术在中医药

研究中的应用概况，为后续研究提供参考。

1应用现状

1.1中药药效机制研究

1.1.1单味中药：在单味中药药效机制研究中，多先分别采用代谢组学和网

络药理学方法进行分析，再对所得靶点或通路进行交集处理，以探寻从基因到代

谢物的完整途径。芜菁具有补虚弱、抗炎、缓解急性高原病等多种药理作用，在

青藏高原地区被广泛食用、饲养用和药用，但其抗疲劳作用机制尚未阐明，Zhu

等［7］通过网络药理学和广泛靶向代谢组学研究芜菁提取物抗疲劳作用机制，

基于超高效液相色谱-质谱法鉴定出33个成分，通过网络药理学基因功能富集分

析认为，能量代谢稳态和炎症相关信号通路对于芜菁提取物抗疲劳至关重要；蛋

白质印迹显示，芜菁提取物可上调核转录因子红系2相关因子2/血红素加氧酶-

1、AMPK磷酸化和下游信号通路表达，且通过实时定量PCR进一步验证；代谢途

径分析表明，芜菁提取物主要参与亚油酸代谢，以及酮体生成和降解等，与能量

代谢调节和免疫调节密切相关；此外，含芜菁提取物的药物血清可降低巨噬细胞

Raw264.7内活性氧水平，通过提高IL-10和精氨酸-1水平并在体外抑制IL-12

和诱导型NOS表达，逆转M1型巨噬细胞极化。

此外，基于细胞的代谢组学对研究单药药效机制亦有所贡献。Yu等［8］基

于lHNMR的代谢组学和网络药理学研究远志花石油醚提取物抗肺癌细胞增殖作

用，筛选出15个差异代谢物，推测其可能与丙酮酸、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸

代谢有关。Wang等［9］以A549肺癌细胞为研究对象，探索荆芥穗提取物治疗

非小细胞肺癌的有效成分及作用机制，经细胞代谢组学筛选出23个差异代谢物，

并通过网络药理学推测其可能通过影响嘌呤、花生四烯酸和组氨酸代谢，发挥抗

肿瘤作用。线粒体功能发生障碍引起多种代谢物改变及活性氧产生，并改变参与

能量代谢的多条细胞信号通路。Liu等［10］通过代谢组学分析，探讨饴糖改善

慢性萎缩性胃炎大鼠线粒体功能障碍的作用机制，结果显示，饴糖预处理可调节

氨基酸代谢和脂肪酸β-氧化途径的代谢产物，并采用网络药理学进一步对代谢

产物上游靶点进行预测，为本病进一步研究提供方向。

1.1.2中药药对：中药药对指临床相对固定的二药配伍的特定用药组合，药

对合煎与二药单煎化学成分有所不同［11-12］，药理作用亦有变化［13-14］，

临床常用药