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解放军第三0二医院王海滨

写在课前的话

近几年在临床检测病毒核酸和细菌核酸上,荧光定量

PCR技术越来越广泛。但是如何进行治疗控制以及出现污染

后怎样进行清除污染?本文主要讲述怎样来防止污染的产

生。

一、荧光PCR定量的概述

(一)荧光PCR定量的原理

实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加

入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,

最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。常规

的PCR也就是电泳PCR,它是合成一个正向引物和反向引

物为目的模板,即DNA或RNA作为一个模板扩增,扩增后

通过跑电泳的方式来检测它存在与否,是相对量的变化。由

于跑电泳经常导致产物外泄,因此污染的几率比较高。

近几年PCR扩增时在参入一对引物的同时参入单个特

异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记单个

报告荧光基团和单个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团

发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的

5端~3端外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和

淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,

即每扩增一条DNA链,就有单个荧光分子构成,实现了荧

光信号的累积与PCR产物构成完全同步。

通过荧光物质参入和TapMan探针技术来做实时荧光

PCR,避免了电泳检测结果的过程,使整个PCR过程从扩增

到检测都在一个封闭的状态。荧光集团目前临床常用的有两

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个,一个是SYBRgreen,一个是TapMan探针。SYBR

green是一类荧光染料,能与所有的DNA双链相结合,

对DNA模板没有选择性,所以特异性不如TaqMan探

针。变性后双螺旋变成单链,然后作为扩增的模板。在扩

增的过程中由变性到负性扩出了另一条链和模板DNA进行

退火变成双链。这时SYBRgreen染料与DNA双链结合,

发出荧光信号。用SYBRgreen荧光染料来作为指示剂时,

中间要加一个溶解曲线来证实它的特异性的问题。

另一个是TapMan探针,在两个引物中间设置一条特异

性的探针,它标记有荧光染料通过激发和检测的过程来检测

特异性扩增模板的存在。

(二)PCR原理图

(三)定量原理

定量原理:初始模板量的对数与C(T)循环数之间的线

性关系。初始DNA量越多,荧光达到某一值(域值)时

所需要的循环数越少。域值~Ct值,荧光曲线由潜伏期进

入对数期的拐点。Log浓度与循环数呈线性关系(如图二),

根据样品扩增达到域值的循环数就可计算出样品中所含的

模板量

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图一为PCR扩增曲

线

图二为

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