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#流程大放送#WGBS和RRBS分析流程
知因无限
介绍
WGBS全称WholeGenomeBisulfiteSeuqneicng,即全组
重亚硫酸盐。该方法通过Bisulfite处理,将原组中未发
生甲基化的C碱基转换成U的同时,保留所有甲基化C的碱基不
发生转变,从而帮助科研人员识别发生甲基化的CpG位点。该种
技术适用于绘制单碱基分辨率的全组甲基化图谱。
RRBS全称ReducedRepresentationBisulfiteSequencing,即简
化代表性重亚硫酸盐。该方法在Bisulfite处理前,使用MspI
(该酶的酶切位点为CCGG)酶切对样本进行处理,去除低CG含
量片段,从而使用较小的数据量富集到尽可能多的包含CpG
位点的片段。
相比于WGBS技术,RRBS是一种准确、高效且经济的甲
基化研究方法,通过酶切,并进行Bisulfite,该方法在保证
甲基化状态检测的高分辨率的同时提升数据的高利用
该项技术可用于以下研究
2、比较不同细胞、组织、样本间的高精度甲基化修饰模
式的差异;
3、疾病样本中,与疾病发生发展相关的高精度甲基化表
观遗传机理研究和相关高精度甲基化位点分子标志的探索性
研究。
我们能提供详尽的全组重数据的处理和分析服务。
数据处理和分析流程图
分析结果示例展示
示例图1样本中各区域甲基化水平信息统计和样本间差异甲基化分
析结果展示[1]
示例图2差异甲基化区域内转录因子基序识别[1]
示例图3甲基化水平变化与表达水平变化的关联性分析[1]
示例图文献
[1].Ng,C.W.,etal.,Extensivechangesinme
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