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花生赤霉素代谢途径中三个基因家族鉴定与分析

目录

内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.2研究目的与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.3文献综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

花生赤霉素概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

2.1花生赤霉素的化学结构．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.2花生赤霉素的生物合成途径．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

2.3花生赤霉素的功能及应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

基因家族的定义与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

3.1基因家族的概念．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

3.2基因家族的分类方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

3.2.1基于序列相似性分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

3.2.2基于功能分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

3.2.3基于组织特异性分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

花生赤霉素代谢途径中的基因家族．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

4.1A亚基基因家族．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

4.1.1成员介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

4.1.2功能与调控机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

4.1.3表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

4.2B亚基基因家族．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

4.2.1成员介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

4.2.2功能与调控机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

4.2.3表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

4.3C亚基基因家族．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

4.3.1成员介绍．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

4.3.2功能与调控机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

4.3.3表达模式分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

基因家族鉴定技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

5.1基因组测序技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

5.1.1全基因组测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

5.1.2转录组测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

5.2生物信息学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

5.2.1序列比对与注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

5.2.2同源预测与进化树构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

5.3PCR-DGGE和Southern杂交技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

花生赤霉素代谢途径中基因家族的表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．37

6.1表达谱数据收集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

6.2差异表达基因筛选．．．．