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昆虫分子生态学的
主要原理与研究方法;以昆虫为研究对象,研究昆虫及其周围环境相互关系的科学。它是昆虫学和生态学的分支学科。;昆虫分子生态学
昆虫生理生态学
昆虫种群生态学
昆虫群落生态学
生态系统生态学;一.主要原理;1.根本原理;2.主要理论;二.昆虫分子生态学的研究方法;1.分子标记的方法;表1昆虫分子生态学常用技术比较;RAPD;2.遗传变异的检测方法;三.昆虫分子生态学研究内容;四.昆虫分子生态学的应用;以利用ITS2序列分析赤眼蜂不同地理种群的遗传变异为例。;〔3〕PCR扩增及电泳
PCR反响在Hybaid热循环仪中进行,总反响体积50μL:40.2μL超纯水、5μL10×反响缓冲液〔100mmol/LTris-HCl,pH8.3,500mmol/LKCl,15mmol/LMgCl2〕,0.8μL10mmol/LdNTP混合液,25μmol/L正反引物各1.2μL,1μL模板DNA,0.6μLGIBCOBRLTaq酶〔5U/μL〕。扩增ITS2区段〔两端含局部5S和28S序列〕的引物为:TrichLSf-5′-TTCTCGCATCGATGAAGAACG-3′(forward)和TrichLSr-5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′(reverse)。PCR循环程序为:97℃变性1min,接着进行35个循环:95℃变性1min、50℃退火1min、72℃延伸2min,最后72℃延伸7min,置于4℃保存。PCR产物用1%琼脂糖凝胶电泳别离,1×TAE缓冲液〔0.04mol/LTris-acetatepH8.0,0.002mol/LNa2EDTA〕100bpDNALadder相对分子质量标准参照物,电泳胶用溴化乙啶〔EB〕染色。;〔4〕克隆及测序
电泳后,将约564bp的PCR产物割下,分别置于1.5μL离心管,采用DNA快速纯化试剂盒〔Promega〕回收PCR产物,每样用25μLTEbuffer(10mmol/LTris-HCl,pH8.0,1mmol/LNa2EDTA)收集。连接反响使用5μL回收DNA,载体为Pgem-TVectorSystemⅠ,操作按用户指南。连接产物热激转化入感受态大肠杆菌细胞。阳性克隆鉴定时,先纯化质粒,再用内切酶BstZⅠ(Eco521)(Promega)进行酶切鉴定。酶切反响体积20μL,包括0.2-1.5μgDNA底物和内切酶,混合液37℃水浴3h,用1%琼脂糖胶检测消化反响。最后将每板1-3个阳性克隆测序〔ABIPRISM,Model377〕,采用PharmaciaDNA测序试剂盒双脱氧链终止法。;〔5〕地理种群序列间差异分析
首先采用软件DNAMANv.4.0进行手工比照,并在GenBank作BLAST搜索,然后用另一个软件MegAlign,基于Clustal算法对ITS2进行遗传分歧和相似???分析。Clustal方法通过将所有序列进行两两比照计算其距离,并将序列进行聚类。来自同一个体的阳性克隆用作单个个体内ITS2拷贝间序列差异分析。
〔6〕数据分析;谢谢!
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