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ICS65.020.20
B04
DB12
天津市地方标准
DB12/T838—2018
辣椒种子纯度SSR分子标记鉴定方法
MethodofidentifyingseedpurityofpepperbyusingSSR-basedmarker
2018-11-07发布2018-12-01实施
天津市市场和质量监督管理委员会发布
DB12/T838—2018
前言
本标准按照GB/T1.1—2009给出的规则起草。
本标准由天津市农村工作委员会提出并归口。
本标准起草单位:天津市农业质量标准与检测技术研究所、天津市蔬菜研究中心、黑龙江省农业科
学院农产品质量安全研究所。
本标准主要起草人:兰青阔、吕敬刚、赵新、王成、兰璞、焦荻、高素燕、陈锐、关海涛、张耀中、
焦贺敏。
I
DB12/T838—2018
辣椒种子纯度SSR分子标记鉴定方法
1范围
本标准规定了辣椒种子纯度SSR分子标记鉴定方法的原理、仪器设备及试剂、方法步骤、纯度计算。
本标准适用于辣椒单交种的纯度鉴定。
2规范性引用文件
下列文件对于本标准的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本标
准。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本标准。
GB/T3543.2农作物种子检验规程扦样
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
3术语和定义
下列术语和定义适用于本文件。
3.1
种子纯度seedpurity
种子在SSR分子标记带型方面典型一致的程度,用具有本品种特异带型的种子粒数占鉴定样品种子
粒数的百分率表示,以反映某品种特征特性的一致性程度。
3.2
聚合酶链式反应polymerasechainreaction(PCR)
一种在体外通过酶促反应扩增特异DNA片段的技术。
3.3
简单重复序列simplesequencerepeat(SSR)
由几个核苷酸(1~6个)为重复单位聚集而成的长达几十个至几百个bp(一般为100~200)的串联
重复序列,又称微卫星序列或短串联重复序列,其高度多态性主要来源于串联数目的不同。
3.4
分子标记molecularmarker
以蛋白质、核酸分子的多态性为基础,鉴定生物在遗传上的差异。
4原理
SSR分布于辣椒整个基因组,每个位点上重复单位的数目不同造成了品种间的多态性,利用PCR技术
将多态的SSR扩增出来,通过电泳检测扩增产物,利用电泳图谱进行辣椒种子纯度鉴定。
5仪器设备及试剂
1
DB12/T838—2018
5.1仪器设备
PCR仪;测序电泳槽;水平电泳槽;高压电泳仪(3000V,400mA,400W);万分之一电子天平;
微量加样器;磁力搅拌器;台式离心机;紫外-可见成像系统;胶片观察灯;水平摇床;高压灭菌锅;
pH计等。
5.2试剂
乙二胺四乙酸二钠(EDTA-Na2);三羟甲基氨基甲烷(Tris);盐酸(HC1,36%);十二烷基硫酸
钠(SDS);氯化钠(NaC1);氢氧化钠(NaOH);硼酸;去离子甲酰胺;
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