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计算材料学常用资源下载
内容目录[\h隐藏]
\h
\h一.软件下载
\h1.可视化软件
\h2.计算程序
\h3.科学分析软件
\h二.代码下载
\h1.格式转换
\h2.计算方法
\h三.标准与规范下载
\h四.势函数下载
一.软件下载
可视化软件
\hatomeye:Linux下大规模原子可视化软件
\hVESTA:功能强大的傻瓜式可视化软件
\hVMD:amolecularvisualizationprogramfordisplaying,animating,andanalyzinglargebiomolecularsystemsusing3-Dgraphicsandbuilt-inscripting.
\hXCrySDen:acrystallineandmolecularstructurevisualisationprogramaimingatdisplayofisosurfacesandcontours,whichcanbesuperimposedoncrystallinestructuresandinteractivelyrotatedandmanipulated.ItcanrunonmostUNIXplatforms,withoutanyspecialhardwarerequirements.
计算程序
MDMC
\hLAMMPS:Apowerful,efficient,parallelized,welldocumented,easyextendableandopensourceMDcode.
\hGromacs:AnothernicefreeMDcode.
\hDL-POLY:ageneralpurposeclassicalmoleculardynamics(MD)simulationsoftware.opensource.
\hNAMD:aparallelmoleculardynamicscodedesignedforhigh-performancesimulationoflargebiomolecularsystems.
Abinitio(DFT)
\hVASP:功能强大、使用简单、广泛使用的第一性原理计算程序,非免费
\hQuantum-Espresso:Anice,freeDFTcode
\hAbinit:AnotherpopularopensourceDFTcode
\hSIESTA:alinearscalingDFTcode
科学分析软件
\h1stOpt:即学即会的非线性拟合软件
二.代码下载
格式转换
\hxyz转lammps
\hvasp转lammps
计算方法
\h粒子群优化算法PSO
\h计算多边形面积
\h计算多面体体积
\h判断点在多面体内
\h判断两条之前平行
\hverlet积分算法
\hverlet速度算法
三.标准与规范下载
\h晶格常数表
\h元素结合能表
\h体积热容量表
\h热膨胀系数表
\h体积模量表
四.势函数下载
\hPotentials:AcollectionofEAMpotentialsforsomemetalandalloys.
\hPotfit:Acodetofitatomicpotentialsfromabinitiodata.
\hLAMMPS常用势函数下载
LAMMPS相关文件功能简介
由\h发表于\h2012年5月15日||3,050浏览
这篇文章是为初学LAMMPS的同学准备的,让你了解与LAMMPS相关的文件及其作用,具体的介绍会在其他博文中进行。
整体上来说,与LAMMPS相关的文件可以分为用于输入到LAMMPS的文件和从LAMMPS输出的文件,下面分别介绍。
内容目录[\h隐藏]
\h
\h输入到LAMMPS的文件
\h1.输入脚本
\h2.数据文件
\h3.重启动文件
\h从LAMMPS输出的文件
\h1.日志文件
\h2.结构文件
\h3.
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