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lammps使用手册-中文简版.docx

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计算材料学常用资源下载

内容目录[\h隐藏]

\h

\h一.软件下载

\h1.可视化软件

\h2.计算程序

\h3.科学分析软件

\h二.代码下载

\h1.格式转换

\h2.计算方法

\h三.标准与规范下载

\h四.势函数下载

一.软件下载

可视化软件

\hatomeye:Linux下大规模原子可视化软件

\hVESTA:功能强大的傻瓜式可视化软件

\hVMD:amolecularvisualizationprogramfordisplaying,animating,andanalyzinglargebiomolecularsystemsusing3-Dgraphicsandbuilt-inscripting.

\hXCrySDen:acrystallineandmolecularstructurevisualisationprogramaimingatdisplayofisosurfacesandcontours,whichcanbesuperimposedoncrystallinestructuresandinteractivelyrotatedandmanipulated.ItcanrunonmostUNIXplatforms,withoutanyspecialhardwarerequirements.

计算程序

MDMC

\hLAMMPS:Apowerful,efficient,parallelized,welldocumented,easyextendableandopensourceMDcode.

\hGromacs:AnothernicefreeMDcode.

\hDL-POLY:ageneralpurposeclassicalmoleculardynamics(MD)simulationsoftware.opensource.

\hNAMD:aparallelmoleculardynamicscodedesignedforhigh-performancesimulationoflargebiomolecularsystems.

Abinitio(DFT)

\hVASP:功能强大、使用简单、广泛使用的第一性原理计算程序,非免费

\hQuantum-Espresso:Anice,freeDFTcode

\hAbinit:AnotherpopularopensourceDFTcode

\hSIESTA:alinearscalingDFTcode

科学分析软件

\h1stOpt:即学即会的非线性拟合软件

二.代码下载

格式转换

\hxyz转lammps

\hvasp转lammps

计算方法

\h粒子群优化算法PSO

\h计算多边形面积

\h计算多面体体积

\h判断点在多面体内

\h判断两条之前平行

\hverlet积分算法

\hverlet速度算法

三.标准与规范下载

\h晶格常数表

\h元素结合能表

\h体积热容量表

\h热膨胀系数表

\h体积模量表

四.势函数下载

\hPotentials:AcollectionofEAMpotentialsforsomemetalandalloys.

\hPotfit:Acodetofitatomicpotentialsfromabinitiodata.

\hLAMMPS常用势函数下载

LAMMPS相关文件功能简介

由\h发表于\h2012年5月15日||3,050浏览

这篇文章是为初学LAMMPS的同学准备的,让你了解与LAMMPS相关的文件及其作用,具体的介绍会在其他博文中进行。

整体上来说,与LAMMPS相关的文件可以分为用于输入到LAMMPS的文件和从LAMMPS输出的文件,下面分别介绍。

内容目录[\h隐藏]

\h

\h输入到LAMMPS的文件

\h1.输入脚本

\h2.数据文件

\h3.重启动文件

\h从LAMMPS输出的文件

\h1.日志文件

\h2.结构文件

\h3.

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