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Haseman-Elston线性回归方法
1。定量性状值对性状位点IBD值的回归方程
条件:
1.假定性状为数量性状
2.假定控制数量性状的为单(单点
)
3.假定通过父母和同胞对能有确定的IB
D值
一、表现型相似程度描述
假设数量性状服从下面的模型
1某家庭两个兄弟姐妹计为个同胞对,标记:1,2
2某数量性状标记为:,同胞对的性状表示为:
3数量性状简单模型:
:型值
一对A1A2
型AAAAAA
111222
型值+ad-a
-ad0a
用数轴图表示
:群体该性状总平均值
:型值
:环境和其他因素对数量性状的影响
表现型相似性:
表现型越相似,y越小
二、型相似程度描述
IBD
IBD/IBS
血缘一致(identicalbydescent,IBD):
指的是子代有的一段区域或共有的等位于
一个共同的祖先。
状态一致(identicalbystate,IBS):
只考虑家系成员之间遗传标记或等位的相似性,
是否于一个共同的祖先,也不需进行亲代的等位分型。
1/21/31/21/31/21/3
1/31/21/11/31/21/2
IBD=0IBS=1IBD=1IBS=1IBD=2IBS=2
相似程度:IBD:0、1、2越相似,IBD越大
差别:-IBD越相似,-IBD越小
表现型差别:
表现型越相似,y越小
同胞对的越相似,他们的定量性状的差距越小
y
t
i
r
a
l
i
m
i
s
c
i
p
y
t
o
n
e
h
P
00.51
Genotypicsimilarity()
ˆ
模型推导:HasemanElston
通过9种兄弟对型和相关条件概率,加性
差、显性方差显性方差,假定和环境独立进行推导,确
立了
定量性状值对性状位点IBD值的回归方程
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