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ICS11.220B41
DB21
辽宁省地方标准
DB21/T2252—2014
O型口蹄疫病毒RT-PCR检测方法
MethodofRT-PCRforthedetectionoftypeOfootandmouthdiseasevirus
2014-03-07发布2014-05-07实施
辽宁省质量技术监督局发布
1
DB21/T2252—2014
O型口蹄疫病毒RT-PCR检测方法
1范围
本标准规定了O型口蹄疫病毒(FMDV-O)RT-PCR检测方法的实验材料、仪器设备、试剂、操作步骤和结果判定,并介绍了其原理。
本标准适用于动物及动物产品中O型口蹄疫病毒的检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682-1992分析实验室用水规格和试验方法
中华人民共和国农业部公告第302号兽医实验室生物安全技术管理规范
3缩略语
下列缩略语适用于本标准。
DEPC
焦炭酸二乙酯
RNA
核糖核酸
RT-PCR
反转录聚合酶链反应
dNTP
脱氧核苷酸三磷酸
bp
碱基对
O-P液
牛、羊食道-咽部分泌物
4原理
FMDV是一种RNA病毒。RNA反转录产生的cDNA可作为PCR模板进行扩增。根据FMDV-O保守基因序列设计一对引物,在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以引物为延伸起点,通过变性、退火和延伸,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA。
5实验材料、仪器设备和试剂
5.1实验材料
眼科剪、眼科镊、称量纸、1.5mL灭菌离心管(经DEPC水处理)、0.2mL薄壁PCR管、琼脂糖、500mL量筒、500mL三角瓶、吸头(10μL、200μL、1000μL)。
5.2仪器设备
2
DB21/T2252—2014
分析天平、低温高速离心机、PCR扩增仪、电泳仪、电泳槽、紫外凝胶成像仪(或紫外分析仪)、-70℃冰箱、微波炉、组织研磨器、-20℃冰箱、可调移液器(最大量程分别为2μL、20μL、200μL、1000μL)。
5.3试剂
5.3.12.5mmol/LdNTP。
5.3.2引物:上游引物5′-AGATTTGTGAAAGTAACACCA-3′,下游引物5′-CATGTCCTCTTGCATCTGGTT-3′。
5.3.310倍PCR缓冲液。
5.3.41%溴化乙锭(EB)溶液(见第A.1)。
5.3.5电泳缓冲液(50倍)(见第A.2)。
5.3.61%琼脂糖凝胶(见第A.3)。
5.3.775%乙醇(见第A.4)。
5.3.8灭菌DEPC水(见第A.5)。
5.3.9上样缓冲液(见第A.6)。
5.3.10电泳缓冲液(1倍)(见第A.7)。
5.3.11磷酸盐缓冲液(0.04mol/L、pH7.4)(见第A.8)。
5.3.12其他试剂:10U/μLAMV反转录酶、50U/μLRNA酶抑制剂、5U/μLTaqDNA聚合酶、异丙醇、
25mmol/L氯化镁溶液。
注:除另有规定,所用试剂均为分析纯,水为符合GB/T6682-1992的灭菌双蒸水或超纯水。
6操作步骤
6.1样品的采集、保存运送和处理
6.1.1样品采集
6.1.1.1水泡液:未破裂水泡中的水泡液用灭菌注射器吸出后装入灭菌小瓶中(可加青霉素1000UI/mL,链霉素1mg/mL),加盖密封,编号。
6.1.1.2水泡皮:剪取新鲜水泡皮3~5g放入灭菌小瓶中,加6~10mL(2倍体积)50%甘油-磷酸盐缓冲液(0.04mol/L、pH7.4),加盖密封,编号。
6.1.1.3肌肉或组织样品:无菌采集淋巴结、脊髓、肌肉等组织样品3~5g装入洁净的小瓶内或其他灭菌容器,编号。
6.1.1.4O-P液样品:被检动物在采样前禁食(可饮水)12小时,以免反刍胃内容物严重污染O-P液。采样探杯在使用前经0.2%柠檬酸或2%氢氧化钠浸泡5min,再用自来水冲洗。每采完一头动物,探杯要重复进行消毒和清洗。采样时动物站立保定,将探杯随吞咽动作送入食道上部10~15cm处,轻轻来回移动2~3次,然后将探杯拉出。如采集的O-P液被反刍胃内容
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