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黄瓜新矮化突变体的表型调查与转录组分析
目录
黄瓜新矮化突变体的表型调查与转录组分析（1）．．．．．．．．．．．．．．．．4
一、内容概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.2研究目的与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.3研究方法与技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
2.1材料来源与选育．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
2.2突变体筛选与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8
2.3表型调查方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
2.4转录组分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10
三、表型鉴定与描述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
3.1矮化突变体的表型特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
3.2表型差异的显著性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
3.3表型相关基因的初步筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13
四、转录组数据收集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
4.1样品制备与基因组DNA提取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14
4.2RNA提取与质量检测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15
4.3转录组测序与数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
五、转录组数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
5.1基因表达谱分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
5.2转录本结构分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
5.3功能注释与代谢途径分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19
六、转录组与表型的关联分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
6.1基因表达与表型相关性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21
6.2转录因子预测与验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
6.3转录组数据整合分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23
七、结论与展望．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
7.1研究主要发现．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
7.2研究不足与局限．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25
7.3未来研究方向与应用前景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26
黄瓜新矮化突变体的表型调查与转录组分析（2）．．．．．．．．．．．．．．．27
一、内容简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
1.1研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28
1.2研究意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
1.3研究目的与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29
二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30
2.1材料来源．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
2.2实验设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．
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