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ICS11.220B41
DB22
吉林省地方标准DB22/T3089—2019
羊传染性脓疱病毒检测荧光PCR探针法
TaqManprobe-basedreal-timePCRassayfordetectionoforfvirus
2019-12-25发布2020-02-01实施
吉林省市场监督管理厅发布
I
DB22/3089—2019
前言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。本标准由吉林省畜牧业管理局提出并归口。
本标准起草单位:吉林省畜牧兽医科学研究院。
本标准主要起草人:邵洪泽、王楠、王龙涛、王开、程荣华、柴方红、于钦磊、董航、葛永明、呼延含蓉、任锐、王欣宇。
1
DB22/T3089—2019
羊传染性脓疱病毒检测荧光PCR探针法
1范围
本标准规定了羊传染性脓疱病毒(ORFV)ORF059基因荧光PCR检测方法的技术要求。本标准适用于羊传染性脓疱病毒基因的检测。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB19489实验室生物安全通用要求
GB/T27401实验室质量控制规范动物检疫NY/T3235羊传染性脓疱诊断技术
3缩略语
下列缩略语适用于本文件。
ORFV:羊传染性脓疱病毒(Orfvirus)
ORF:开放阅读框(OpenReadingFrame)
DNA:脱氧核糖核酸(Deoxyribonucleicacid)Ct:循环阈值(Cyclethreshold)
4原理
根据羊传染性脓疱病毒(ORFV)ORF059基因序列设计引物和探针,探针在5’端标记FAM荧光素作为报告荧光基团,3’端分别标记TAMRA作为淬灭荧光基团。反应进入退火阶段时,引物和探针同时与目的基因片段结合,此时探针上荧光基团发出的荧光信号被淬灭基团所吸收,仪器检测不到荧光信号;而反应进行到延伸阶段时,Taq酶发挥5’→3’的外切核酸酶功能,将探针降解。探针上的荧光基团游离出来,所发出的荧光不再为淬灭基团所吸收而被检测仪所接收。随着PCR反应的循环往复,PCR产物呈指数形式增长,荧光信号也相应增长。
5试验条件
5.1生物安全要求
所有培养物和废弃物的处置应符合GB19489的规定。5.2防污染措施
防止污染措施应符合GB/T27401的规定。
2
DB22/T3089—2019
6试剂和材料
6.1试剂
6.1.1病毒DNA提取试剂盒。
6.1.2TapPathMasterMix。
6.1.3阳性对照:灭活的羊传染性脓疱病毒细胞培养物。
6.1.4阴性对照:不含羊传染性脓疱病毒细胞培养液。
6.1.5空白对照:ddH2O。6.2耗材
6.2.1吸头,200μL~1000μL、20μL~200μL、2μL~20μL、0.5μL~10μL。
6.2.2离心管,1.5mL。
6.2.3荧光PCR反应管,根据荧光PCR仪要求选择单管、八连排管或96孔荧光反应板。
6.3引物和探针
根据羊传染性脓疱病毒(ORFV)ORF059基因序列设计合成一对特异性引物和探针。上游引物5-TTGCACATGTCCGTGAAGAAGT-3。
下游引物5-AGGCGGTGGAATGGAAAGAC-3。
TaqMan探针(FAM)5-CGGGTAGTCTTTGGAGTC-3(TAMRA)。均配制成20μmol/L,-20℃避光保存,6个月内使用。
7仪器
7.1冰箱,-20±2℃。
7.2低温高速离心机,不低于12000r/min。
7.3可调微量移液器,200μL~1000μL、20μL~200μL、2μL~20μL、0.5μL~10μL。7.4荧光PCR仪。
8样品
样品的采集和处理按NY/T3235规定进行。
9操作步骤
9.1模板的制备
采用病毒DNA提取试剂盒(6.1.1)提取(6.2.1、6.2.2、7.2、7.3)待检样品的核酸作为模板。阳性对照(6.1.3)、阴性对照(6.1.4)均按照待检样品提取方法进行操作。
9.2反应体系
用可调微量移液器(7.3)按表1中各组分依次加入荧光PCR反应管(6.2.3)后瞬
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