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螺旋-转角-螺旋(HTH)由两个7-9个氨基酸残基组成的?螺旋。一个用于识别DNA,结合在DNA分子的大沟中。锌指(zincfinger)见于TFⅢA和类固醇激素受体中,由一段富含半胱氨酸的多肽链构成。每四个半胱氨酸残基或His残基螯合一分子Zn2+,其余约12-13个残基则呈指样突出,刚好能嵌入DNA双螺旋的大沟中而与之相结合。每个蛋白质分子中可含2-9个锌指结构。常结合DNA的GC盒,也有与mRNA结合的功能。同质异形结构域由60个氨基酸残基组成,结构与HTH相似。在真核生物发育,如身体形成期间起作用。编码这种结构域的DNA序列,叫做同质异形盒。logo调节蛋白中蛋白质-蛋白质相互作用结构域绝大多数调节蛋白质结合DNA前,需通过蛋白质-蛋白质相互作用,形成二聚体或多聚体。(同质或异质)也有的是在结合DNA前,需要蛋白质与蛋白质之间的解聚过程亮氨酸拉链(zip)二聚体亮氨酸之间相互作用形成二聚体,形成“拉链”。肽链氨基端20~30个富含碱性氨基酸结构域与DNA结合。亮氨酸拉链碱性螺旋-环-螺旋(HLH)可形成二聚体由50个氨基酸残基的保守区组成肽环长度可变碱性螺旋与DNA结合RNA聚合酶DNA顺式作用元件、调节蛋白对转录激活的调节最终是由RNA聚活酶的活性体现的。启动子的结构、调节蛋白的性质对RNA聚活酶活性影响最大。logo启动序列与RNA聚合酶活性启动子有强弱只分,原核、真核启动子碱基序列影响RNA聚合酶与其亲和力,进而影响转录启动频率。启动子序列的差别,使细胞中不同的管家基因在不同的水平表达。logo调节蛋白与RNA聚合酶活性启动序列决定基础转录频率,一些特异调节蛋白在适当环境信号(如诱导剂和阻遏剂等)刺激下在细胞内表达,然后通过DNA-蛋白质、蛋白质-蛋白质相互作用影响RNA聚合酶活性,使基础转录频率发生变化,从而引起表达的变化。PARTONE第二节
原核生物基因转录调节——调节的主要环节在转录起始一、原核生物基因转录调节特点(1)σ因子决定RNA聚合酶识别特异性——只有一种RNA-pol,但是有很多种σ因子(2)操纵子模型的普遍性—功能相关基因成簇串联通过单个启动子协调表达(3)阻遏蛋白与阻遏机制的普遍性——原核生物主要以这种负调节方式为主二、乳糖操纵子调节机制(1)乳糖操纵子(lacoperon)的结构结构基因Z:β-半乳糖苷酶Y:透酶A:乙酰基转移酶调控区CAP结合位点启动序列操纵序列ZYAOPDNAmRNA阻遏蛋白IDNAZYAOPpol没有乳糖存在时(2)阻遏蛋白的负性调节调节基因mRNA阻遏蛋白有乳糖存在时IDNAZYAOPpol启动转录mRNA乳糖半乳糖β-半乳糖苷酶CAP—降解物基因活化蛋白CAP-cAMP复合物CAP++++转录无葡萄糖,cAMP浓度高时有葡萄糖,cAMP浓度低时(3)CAP的正性调节ZYAOPDNACAPCAPCAPCAPCAPCAP调节基因转录翻译阻遏蛋白R,R与操纵基因结合,阻止结合在启动子上的RNA-pol前移,结构基因不被转录。1)无乳糖也无葡萄糖存在时:2)当无乳糖,有葡萄糖时:由于葡萄糖不能使阻遏蛋白失活,乳糖操纵子关闭,另外,由于有葡萄糖,cAMP含量低,CAP的正性调节不起作用。总结:所以:无乳糖时,无论有无葡萄糖,操纵子关闭OPOP乳糖与阻遏蛋白结合,使阻遏蛋白变构,失去与操纵基因结合的能力而脱落。3)既有乳糖,又有葡萄糖时:由于葡萄糖降解物能降低cAMP含量,不与CAP形成复合物,CAP不能结合到启动子附近,RNA聚合酶不能有效转录,使细菌只能利用葡萄糖。O细胞内cAMP含量高,cAMP与CAP结合成复合物,与DNA结合,并推动RNA-pol向前移动,促进转录。4)有乳糖,无葡萄糖时:mRNARNA-polO乳糖与阻遏蛋白结合,使阻遏蛋白变构,失去与操纵基因结合的能力而脱落,结合在启动子上的RNA-pol向前移动,结构基因被转录翻译,合成与乳糖代谢有关的酶类从而利用乳糖。所以:有乳糖时,没有葡萄糖,操纵子才开放;有葡萄糖存在,操纵子关闭(4)协调调节葡萄糖对lac操纵子的阻遏作用称分解代谢阻遏。阻遏蛋白封闭转录时,CAP对该系统不能发挥作用;没有阻遏蛋白与操纵序列结合,如无CAP
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