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CHINARCHOTOLARYNGOLHEADNECKSURG/May2024,Vol.31,No.5287
DOI:10.16066/j.1672-7002.2024.05.004论著
基于淋巴结转移相关基因的头颈部鳞状细胞癌预后模型构建
和肿瘤免疫微环境分析
朱光浩,姚慧,李昊璞,王经杰,朱敏辉,郑宏良
海军军医大学附属长海医院耳鼻咽喉头颈外科,上海200433
TCGAheadandnecksquamouscellcarcinoma
[摘要]目的基于癌症基因组图谱()数据库筛选与头颈部鳞状细胞癌(,
HNSCCRTCGAHNSCC
)淋巴结转移相关的关键基因并构建预后模型。方法利用软件筛选数据库中数据集中肿瘤组
differentiallyexpressedgenesDEGsweightedgene
织和癌旁组织之间的差异表达基因(,),并通过加权基因共表达网络(
co-expressionnetworkanalysisWGCNACoxLasso
,)筛选与淋巴结转移相关的基因模块。使用单变量回归和回归分析构建
ROCCIBERSORT
预后风险模型,通过生存分析和受试者工作特征()曲线验证预后模型的可靠性。最后使用算法分析不
tumormicroenvironmentTME2565DEGsWGCNA
同风险组的肿瘤微环境(,)的差异。结果筛选出个,通过分析得到与
疾病预后和淋巴结转移高度相关的一组基因模块,相关性分析验证该基因模块中的基因表达与淋巴结转移高度相关。通
CoxLasso6CDKN2ACCNE2KNSTRNAURKAKPNA2ORC1
过单因素回归和回归筛选出了个关键预后基因:、、、、和。基于这
6P0.0001ROC
个基因构建预后模型,生存分析显示高风险组的预后显著差于低风险组()。曲线表明该预后模型具有良
CIBE
初级会计持证人
专注于经营管理类文案的拟写、润色等,本人已有10余年相关工作经验,具有扎实的文案功底,尤善于各种框架类PPT文案,并收集有数百万份各层级、各领域规范类文件。欢迎大家咨询!
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