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X射线成像和深度学习的交叉融合
摘要:作为人工智能(artificialintelligence,AI)的主流,深度学习在计算机视觉、图像多尺度特征提取领域已有所进展。2016年以来,深度学习方法在计算机断层成像(从积分特性,如线积分,实现内部结构的图像重建)方面也取得了进步。总体而言,在人工智能领域,尤其是基于人工智能的成像领域,令人兴奋的前景和挑战并存,包括准确性、鲁棒性、泛化性、可解释性等一系列问题。基于2021年8月2日SPIEOptics+Photonics上的大会邀请报告,本文介绍X射线成像和深度学习的背景,低剂量CT、稀疏数据CT、深度影像组学的代表性成果,讨论对于X射线CT、其他成像模式以及多模态成像而言,数据驱动和模型驱动方法融合带来的机会,以期显著促进精准医疗的进步。
关键词:深度学习;机器学习;人工智能;生物医学成像;X射线成像;CT;多模态成像
1引言
自1895年伦琴发现X射线以来(1901年获诺贝尔奖),X射线成像领域一直在稳步发展。Hounsfield和Cormack在X射线断层成像领域方面开拓性的工作(1979年获诺贝尔奖)对医学领域而言极为重要。2009年,伦敦科学博物馆邀请馆长们从馆藏中选出十件最重要的物品,然后邀请公众从中选出一件最有影响力的发明,X射线成像获得了5万投票中的9581票,排名第一[1]。如今,X射线摄影和断层成像技术已经应用于各种场景,成像分辨率和视野大小跨越6个数量级,包括了不同的成像模态,例如衰减、光子计数、相衬、暗场成像,以及圆轨道、螺旋轨道、机械臂扫描。生物医学成像是其最重要的应用领域。过去几年里,深度学习在一些领域已经取得了成功,包括生物医学成像,尤其是X射线断层成像[2-5]。
Kuhn在他的著作《科学革命的结构》中提出科学的进步是通过范式转移实现的。4种基本科学范式分别是:经验科学(描述自然现象)、理论科学(归纳和建立模型)、计算科学(模拟现象和过程)和数据驱动科学(通过深度网络和高性能计算技术从大数据中提取知识)。目前,我们正处在第4种科学范式阶段,也被称为数据科学、人工智能、机器学习和深度学习。
让我们首先回顾一下深度学习的概念(图1)。深度学习是指利用深度人工神经网络进行机器学习,虽然人工神经网络有很多,但它们的构建模块都是简单的人工神经元。人工神经元是生物神经元的模型,在人工神经元中,很多输入信号分别被加权和相加,这个过程是一种内积形式的线性运算。内积通过阈值或非线性激活函数来决定神经元是否应该被激活,也即它应该取大值还是小值。有多种激活函数,如SigmoidS(x)=1/(1+e-x),值域为(0,1),以及ReLUR(x)=max(0,x)。前馈网络是一种常见的网络结构,其中有输入层、输出层以及两者之间的隐藏层。输入向量被逐层处理(一层的输出作为下一层的输入),最后输出层给出结果。除了前馈网络,还有许多其他类型的结构可以使用。粗略来说,深度网络包含许多隐藏层,便于多尺度分析和知识表达(图1)。
…Forwardcomputaioutput:1xx
…
Forwardcomputaion
1
2
3
4
5
6
7
8
Output:1
xx
x
Input
y
Label:5
Output
BackwardCorrection
Error:4
Linearw
w
wInner
w
Inner
Nonlinear
9
图1深度学习的基本思想。神经网络由相互连接的神经元组成,每个神经元先执行线性
计算(内积),再执行非线性运算(阈值化,如ReLU)。神经元之间的权重参数被随机初始化,并通过使用训练数据迭代更新以期损失函数最小化(例如上图迭代中显示为“4”的绝对误差),最终输出正确答案(在本例中为“5”)
图1中的前馈网络只包含一个隐藏层,但它在数字识别方面已经做得很好了(给定一个手写数字的图像,网络可以识别它)。输入是一个矢量化的数字图像,输出层是所谓的“独热编码”,即有且只有一个元素将被激发到高于其他元素值的状态,且这个被激活的元素/神经元就代表输入数字的值(在独热编码中,每个数字被分配给唯一的神经元)。最初,网络的参数是随机初始化的。对于给定的输入图像,可以计算隐含层的输出结果以及网络的输出向量。通常,这个输出不太可能和我们想要的结果完全匹配,但我们可以通过反向传播方式的梯度下降法调整当前的权重参数,以减小误差。如果有许多隐藏层,上述前向计算和反向传播过程也是类似的。
目前,已经有很多流行的深
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