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ICS11.220
B41
DB34
安徽省地方标准
DB34/T2515—2015
猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测方法
RT-PCRassayforporcineepidemicdiarrheavirus
安徽省质量技术监督局发布
DB34/T2515—2015
前言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则编写。
本标准由安徽省农业标准化委员会归口。
本标准由安徽省农业科学院畜牧兽医研究所提出。
本标准起草单位:安徽省农业科学院畜牧兽医研究所。
本标准起草人:潘孝成、张丹俊、赵瑞宏、沈学怀、周学利、胡晓苗、戴银、侯宏艳、李贺侠、张
宁、何国荣、周德权、王庆。
I
DB34/T2515—2015
猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测方法
1
范围
本标准规定了猪流行性腹泻病毒(porcineepidemicdiarrheavirus,PEDV)RT-PCR检测方法及
其技术要求。
本标准适用于猪肠内容物、粪便以及细胞培养物中PEDV核酸的检测。
2缩略语
下列缩略语适用于本文件。
PEDV:猪流行性腹泻病毒(porcineepidemicdiarrheavirus)
PCR:聚合酶链式反应(polymerasechainreaction)
RT-PCR:反转录聚合酶链式反应(reversetranscription-polymerasechainreaction)
RNA:核糖核酸(ribonucleicacid)
DEPC:焦炭酸二乙酯(diethylpyrocarbonate)
Taq酶:TaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)
3原理
根据PEDV保守基因序列设计一对引物,在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以引物为延
伸起点,通过变性、退火和延伸,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA。
4仪器
1
DB34/T2515—2015
4.8水浴锅。
4.9微量移液器。
5试剂和材料
5.1RNA抽提试剂:Trizol。
5.2氯仿、异丙醇、乙醇。
5.3M-MLV反转录酶。
5.4RNA酶抑制剂。
5.5DEPC处理的灭菌水。
5.6TaqDNA聚合酶。
5.7dNTP。
5.8DL2000DNAMarker。
5.9RT-PCR反应试剂。
5.10溴化乙锭(EB,10μg/μL)或核酸染料。
5.11磷酸盐缓冲液(PBS,0.01mol/L,pH7.2),见附录A中的A.1。
5.1250×TAE电泳缓冲液,见附录A中的A.2。
5.131%琼脂糖凝胶,见附录A中的A.3。
5.14引物:
——上游引物5’-GTGGTCGGAAGAGTAATAACATAC-3’,
——下游引物5’-CCCATGAAGCACTTTCTCACTATC-3’,
——引物浓度10pmol/μL。
6操作步骤
6.1样品的采集及处理
15mL离心管、1.5mL离心管、剪刀、镊子和研钵,经121(±2)℃,15min高压灭菌并烘干。
采取病死或剖杀猪的小肠内容物,按1:5倍体积加入PBS,研磨冻融3次,装入15mL灭菌离
心管中,8000rpm离心10min,取上清液转入1.5mL离心管中,-80℃保存备用。
取发病猪新鲜粪便,装入15mL灭菌离心管中,按1:5倍体积加入PBS,混匀,8000rpm离心10
min,取上清液转入1.5mL离心管中,-80℃保存备用。
6.2RNA提取
2
DB34/T2515—2015
6.2.1用Trizol提取待测样品、阳性对照和阴性对照样品的RNA。
200μL的样品和800μLTrizol置于一个1.5mL离心管,反复颠倒混匀,室温静置5min。
6.2.2
6.2.312000g4℃离心5min,吸取上清移入新的离心管中,加入200μL氯仿,用手剧烈振荡15s,
室温静置5min。
6.2.412000g4℃离心15min,吸取上层水相移入新的离心管中,加入等体积异丙醇,上下颠倒混
匀,室温静置10min。
6.2.512000g4℃离心10min,小心弃去上清,加入75%乙醇1mL(DEPC水配制)。
6.2.612000g4℃离心5min,弃去乙醇,室温干燥2~5min,加入适量DEPC水
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