DB34_T2515-2015_猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测方法_安徽省.docxVIP

DB34_T2515-2015_猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测方法_安徽省.docx

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ICS11.220

B41

DB34

安徽省地方标准

DB34/T2515—2015

猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测方法

RT-PCRassayforporcineepidemicdiarrheavirus

安徽省质量技术监督局发布

DB34/T2515—2015

前言

本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则编写。

本标准由安徽省农业标准化委员会归口。

本标准由安徽省农业科学院畜牧兽医研究所提出。

本标准起草单位:安徽省农业科学院畜牧兽医研究所。

本标准起草人:潘孝成、张丹俊、赵瑞宏、沈学怀、周学利、胡晓苗、戴银、侯宏艳、李贺侠、张

宁、何国荣、周德权、王庆。

I

DB34/T2515—2015

猪流行性腹泻病毒RT-PCR检测方法

1

范围

本标准规定了猪流行性腹泻病毒(porcineepidemicdiarrheavirus,PEDV)RT-PCR检测方法及

其技术要求。

本标准适用于猪肠内容物、粪便以及细胞培养物中PEDV核酸的检测。

2缩略语

下列缩略语适用于本文件。

PEDV:猪流行性腹泻病毒(porcineepidemicdiarrheavirus)

PCR:聚合酶链式反应(polymerasechainreaction)

RT-PCR:反转录聚合酶链式反应(reversetranscription-polymerasechainreaction)

RNA:核糖核酸(ribonucleicacid)

DEPC:焦炭酸二乙酯(diethylpyrocarbonate)

Taq酶:TaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)

3原理

根据PEDV保守基因序列设计一对引物,在DNA聚合酶催化下,以母链DNA为模板,以引物为延

伸起点,通过变性、退火和延伸,体外复制出与母链模板DNA互补的子链DNA。

4仪器

1

DB34/T2515—2015

4.8水浴锅。

4.9微量移液器。

5试剂和材料

5.1RNA抽提试剂:Trizol。

5.2氯仿、异丙醇、乙醇。

5.3M-MLV反转录酶。

5.4RNA酶抑制剂。

5.5DEPC处理的灭菌水。

5.6TaqDNA聚合酶。

5.7dNTP。

5.8DL2000DNAMarker。

5.9RT-PCR反应试剂。

5.10溴化乙锭(EB,10μg/μL)或核酸染料。

5.11磷酸盐缓冲液(PBS,0.01mol/L,pH7.2),见附录A中的A.1。

5.1250×TAE电泳缓冲液,见附录A中的A.2。

5.131%琼脂糖凝胶,见附录A中的A.3。

5.14引物:

——上游引物5’-GTGGTCGGAAGAGTAATAACATAC-3’,

——下游引物5’-CCCATGAAGCACTTTCTCACTATC-3’,

——引物浓度10pmol/μL。

6操作步骤

6.1样品的采集及处理

15mL离心管、1.5mL离心管、剪刀、镊子和研钵,经121(±2)℃,15min高压灭菌并烘干。

采取病死或剖杀猪的小肠内容物,按1:5倍体积加入PBS,研磨冻融3次,装入15mL灭菌离

心管中,8000rpm离心10min,取上清液转入1.5mL离心管中,-80℃保存备用。

取发病猪新鲜粪便,装入15mL灭菌离心管中,按1:5倍体积加入PBS,混匀,8000rpm离心10

min,取上清液转入1.5mL离心管中,-80℃保存备用。

6.2RNA提取

2

DB34/T2515—2015

6.2.1用Trizol提取待测样品、阳性对照和阴性对照样品的RNA。

200μL的样品和800μLTrizol置于一个1.5mL离心管,反复颠倒混匀,室温静置5min。

6.2.2

6.2.312000g4℃离心5min,吸取上清移入新的离心管中,加入200μL氯仿,用手剧烈振荡15s,

室温静置5min。

6.2.412000g4℃离心15min,吸取上层水相移入新的离心管中,加入等体积异丙醇,上下颠倒混

匀,室温静置10min。

6.2.512000g4℃离心10min,小心弃去上清,加入75%乙醇1mL(DEPC水配制)。

6.2.612000g4℃离心5min,弃去乙醇,室温干燥2~5min,加入适量DEPC水

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