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药物设计软件：AMBER二次开发_（8）.自由能计算与药物设计.docx

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    自由能计算与药物设计

    引言

    自由能计算（FreeEnergyCalculation,FEC）在药物设计中扮演着至关重要的角色。通过计算药物分子与受体蛋白之间的结合自由能，研究人员可以评估潜在药物分子的结合强度和稳定性，从而指导药物的优化和筛选。AMBER是一款广泛使用的分子动力学模拟软件，它提供了多种自由能计算方法，如热力学积分（ThermodynamicIntegration,TI）、自由能扰动（FreeEnergyPerturbation,FEP）和能量重叠采样（EnergyRepresentationSampling,ERS）

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