生物化学：第四章 核酸.ppt

3）真核mRNA5’-“帽子”结构(P229)“帽子”结构：甲基化的鸟苷酸通过焦磷酸与真核mRNA5’-末端的核苷酸以5’、5’-三磷酸二酯键相连。三种帽子结构：?O型：m7G5’ppp5’NpI型：m7G5’ppp5’NmpNpII型：m7G5’ppp5’NmpNmpNp可能功能：抵抗5’核酸外切酶降解mRNA。为核糖体提供识别位点，使mRNA很快与核糖体结合，促进蛋白质合成起始复合物的形成。**4）原核mRNA无5’帽子和3’polyA，但有5’端先导区。SD序列：5’端先导区中，有一段富含嘌呤的碱基序列，典型的为5’-AGGAGGU-3’，位于起始密码子AUG前约10核苷酸处，此序列由Shine和Dalgarno发现，称SD序列。通过SD序列和核糖体16S的rRNA的3’末端富含嘧啶碱基的序列互补。（三）rRNArRNA与核糖体结合蛋白一起构成核糖体。大肠杆菌中有三类rRNA（原核）：5SrRNA、16SrRNA、23SrRNA真核细胞有四类rRNA：5SrRNA、5.8SrRNA、18SrRNA、28SrRNA一、DNA的分子结构（一）DNA的一级结构1.定义：指DNA分子中脱氧核苷酸的排列顺序。即数量庞大的四种碱基的排列顺序。2.DNA的碱基组成（Chargaff定则）：（1）在所有的DNA中，A=T，G=C即A+G=T+C（2）DNA的碱基组成具有种的特异性，即不同生物物种的DNA具有自己独特的碱基组成，但没有组织和器官的特异性。第三节：核酸的分子结构3.DNA一级结构的表示法:5′3′结构式5′3′ppppOH3′ACTG1′线条式5′ACTGCATAGCTCGA3′5′pACTGCATAGCTCGAOH3′字母式DNA测序的生物学意义DNA是遗传信息的储存者和传递者，遗传信息是由碱基序列体现的，碱基序列略有改变，即可引起遗传信息的显著改变。所以DNA测序是研究DNA功能的基础。DNA测序的实验方法双脱氧终止法（Sanger法）和化学法（Gilbert法）4.DNA一级结构的研究方法：DNA的双脱氧终止法测序策略体外合成一段与待测DNA序列互补的随机DNA片段群。Deoxynucleotide;DideoxynucleotideDideoxynucleotidech04\DNASequencing.mov（二）DNA的二级结构1.定义：DNA的二级结构指DNA的两条多聚核苷酸链间通过氢键形成的双螺旋结构。2．DNA双螺旋结构的特点1）DNA由两条反平行的多核苷酸链组成，两条链绕同一中心轴相缠绕，形成右手双股螺旋，一条5’→3’，另一条3’→5’。螺旋上有大沟和小沟。DNAdoublehelixBFormmajorgrooveminorgroove2）嘌呤与嘧啶碱基位于双螺旋的内侧。磷酸与脱氧核糖在双螺旋外侧。磷酸与脱氧核糖彼此通过3’、5’-磷酸二酯键相连接，构成DNA分子的骨架。碱基平面与纵轴垂直，糖环平面与纵轴平行。3）两条核苷酸链，依靠碱基互补形成的氢键结合在一起。A和T之间形成两个氢键，G与C之间形成三个氢键。双螺旋的两条链是互补关系。4）螺旋横截面的直径约为2nm，每条链相邻两个碱基平面之间的距离为0.34nm，每10个核苷酸形成一个螺旋，其螺距（即螺旋旋转一圈）高度为3.4nm。3．DNA双螺旋的稳定因素维持DNA稳定性的主要因素包括：两条DNA链之间碱基配对形成的氢键和碱基堆积力；另外，磷酸基团上的负电荷与介质中的阳离子间形成的离子键及范德华力对维持双螺旋结构的稳定性上也起一定的作用。B-DNA：典型的Watson-Crick双螺旋DNA。右手双股螺旋。在相对湿度为92%时的DNA钠盐。接近DNA在细胞中的构象。A-DNA：在相对湿度为75%以下时的DNA纤维。右手双螺旋，外形粗短，RNA-RNA、RNA-DNA杂交分子具有这种结构。Z-DNA：左手双螺旋DNA。天然B-DNA的局部区域可以形成Z-DNA。4．DNA二级结构的多型性P489表13－6列出了A、B、Z型DNA的主要特征数据。DNA三链结构常出现在DNA复制、重组、转录的起始位点或调节位点。第三股链的存在可能使一些调控蛋白或RNA聚合酶等难以与该