生物化学第二章蛋白质结构与功能.pptVIP

一、蛋白质的一级结构定义：指多肽链中氨基酸的排列顺序主要的化学键：肽健，有些蛋白质还包括二硫键氨基酸序列书写：以N-末端开始，C-末端结束，依次编1、2、3………CysMetPheLysSerThrValNH2COOH第30页，共85页，星期日，2025年，2月5日胰岛素的一级结构各种蛋白质的根本差异在于一级结构的不同第31页，共85页，星期日，2025年，2月5日二、蛋白质的二级结构定义：是指蛋白质分子中一段多肽链的局部空间结构，即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置，并不涉及到aa侧链R基团的构象主要的化学键：氢键负电性很强的原子（如氧或氮）和与氧或氮共价结合的氢原子相互吸引的作用力第32页，共85页，星期日，2025年，2月5日肽键中与Ｃ-Ｎ相连的氧原子和氢原子呈反式构型（反式）（顺式）CNOHCNOH空间结构中肽键的特点：C=N双键为0.127nm因此，肽键具有部分双键性质，不能自由旋转肽键中Ｃ－Ｎ键长为0.132nmC—N单键为0.149nm，第33页，共85页，星期日，2025年，2月5日肽键的6个原子Cα1、C、N、O、H、Cα2位于同一平面，构成所谓的肽单元(peptideunit)第34页，共85页，星期日，2025年，2月5日蛋白质的二级结构类型：α－螺旋结构(α－helix)β－折叠结构(β－pleatedsheet)β-转角(β－turn)无规卷曲(randomcoil)第35页，共85页，星期日，2025年，2月5日(一)α－螺旋由肽键平面盘旋形成的右手螺旋状构象1.概念第36页，共85页，星期日，2025年，2月5日2.α-螺旋的结构特征(1)以肽键平面为单位,以α-碳原子为转折盘旋形成右手螺旋第37页，共85页，星期日，2025年，2月5日(2)每3.6个氨基酸残基绕成一个螺圈(3600)螺距为0.54nm每个氨基酸上升0.15nm肽键平面与中心轴平行第38页，共85页，星期日，2025年，2月5日(3)主链原子构成螺旋的主体,侧链在其外部第39页，共85页，星期日，2025年，2月5日(4)肽键的CO和NH都形成氢键是稳定螺旋的主要作用力氢键的方向与中心轴大致平行,第40页，共85页，星期日，2025年，2月5日（二）β－折叠又叫?-片层，由两条或多条几乎完全伸展的肽链平行排列，通过链间的氢键交联而形成的。肽链的主链呈锯齿状折叠构象在?-折叠中，?-碳原子总是处于折叠的角上，氨基酸的R基团处于折叠的棱角上1.概念第41页，共85页，星期日，2025年，2月5日2.β－折叠结构特点(１)相邻肽键平面的夹角为1100，呈锯齿状排列；侧链Ｒ基团交错地分布在片层平面的两侧第42页，共85页，星期日，2025年，2月5日第43页，共85页，星期日，2025年，2月5日(３)由氢键维持稳定。其方向与折叠的长轴接近垂直(２)２～５条肽段平行排列构成，肽段之间可顺向平行(均从N-C)，也可反向平行第44页，共85页，星期日，2025年，2月5日(三)β－转角肽链出现1800回折的转角处结构称为β－转角1.概念2.结构特征*第一个残基的C=O与第四个残基的N-H形成氢键*常见于球状蛋白质分子表面第45页，共85页，星期日，2025年，2月5日(四)无规卷曲概念没有确定规律性的肽键构象常见于球状蛋白质分子中，在其它类型二级结构肽段之间起活节作用，有利于整条肽链盘曲折叠H2NCOOH第46页，共85页，星期日，2025年，2月5日(五)模体（motif）在许多蛋白质分子中，可发现二个或三个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象，被称为模体第47页，共85页，星期日，2025年，2月5日钙结合蛋白中结合钙离子的模体锌指结构第48页，共85页，星期日，2025年，2月5日三、蛋白质的三级结构（一）定义整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置，也就是整条肽链所有原子在三维空间的排布位置主要的化学键：疏水键、盐键(离子键)、氢键、范德华力第49页，共85页，星期日，2025年，2月5日卵溶菌酶的三级结构含有?螺旋、?-折叠、?-转角和无规卷曲四种二级结构第50页，共85页，星期日，2025年，2月5日疏水作用示意图疏水作用由非极性基团受到水分子排斥相互聚集