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转录组测序揭示呋虫胺胁迫对家蚕组织基因表达的影响研究

目录

内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1.1呋虫胺农药的应用现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.1.2家蚕经济价值与面临的风险．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.1.3转录组测序技术在毒理学研究中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.2国内外研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

1.2.1昆虫对杀虫剂的响应机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

1.2.2家蚕应激反应相关研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

1.2.3转录组学在昆虫非生物胁迫研究中的进展．．．．．．．．．．．．．．．．13

1.3本研究的目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

1.3.1研究目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

1.3.2主要研究内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

2.1实验材料．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

2.1.1家蚕品种与饲养条件．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

2.1.2呋虫胺样品与处理方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

2.2实验设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

2.2.1实验分组．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

2.2.2样品采集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

2.3总RNA提取与质量检测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

2.3.1RNA提取方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

2.3.2RNA质量评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

2.4转录组测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

2.4.1测序平台与流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

2.4.2数据质量控制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

2.5数据分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

2.5.1数据预处理与序列比对．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

2.5.2差异基因表达分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

2.5.3功能注释与通路富集分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

3.1呋虫胺胁迫对家蚕生长指标的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

3.1.1对幼虫体重的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

3.1.2对幼虫发育进程的影响．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

3.2呋虫胺胁迫下家蚕组织总RNA提取与测序质量．．．．．．．．．．．．．．．43

3.2.1RNA提取效果与纯度．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

3.2.2测序数据量与质量评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

3.3呋虫胺胁迫引起家蚕组织差异表达基因分析．．．．．．．．．．．．．．．．47

3.3.1差异表达基因筛选标准．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．