美洲狼尾草GATA转录因子家族生物信息学分析.pdfVIP

第33卷第2期草地学报2025年2月

Vol.33No.2ACTAAGRESTIASINICAFeb.2025

doi：10.11733/j.issn.1007-0435.2025.02.007

引用格式：罗李旋,周涛,徐倩，等.美洲狼尾草GATA转录因子家族生物信息学分析[J].草地学报,2025,33(2):391−400

LOULi-xuan,ZHOUTao,LURui,etal.BioinformaticsAnalysisofGATAFamilyofPennisetumglaucum[J].Acta

AgrestiaSinica,2025,33(2):391−400

美洲狼尾草GATA转录因子家族生物信息学分析

111111，2*

罗李旋，周涛，徐倩，卢蕊，刘宁芳，胡龙兴

（1.湖南农业大学农学院草业科学系，湖南长沙410128；2.黄三角农高区院士工作站，国家盐碱地综合利用

技术创新中心，山东东营257300）

摘要：GATA转录因子在植物生长发育和抗逆等过程中起着重要作用。本研究从美洲狼尾草（Pennisetumglaucum

L.）基因组数据中共鉴定出29个GATA基因家族成员，染色体定位分析显示29个PgGATA基因不均匀地分布在

7条染色体上。根据序列特征和结构域特点将其分为4个亚族，不同亚族成员之间呈现出明显的差异，而在家族内

部成员之间的差异则相对较小。保守基序预测表明GATA结构域在各个亚家族中规律分布。顺式作用元件预测

结果显示，美洲狼尾草GATA基因上游调控序列中存在大量与植物生长发育和逆境胁迫相关的顺式元件。

PgGATA基因家族的表达分析发现多数PgGATAs成员在分蘖组织、叶片以及茎秆中的表达量较高，部分PgGA‐

TAs基因家族成员在高温、干旱以及盐胁迫处理中明显表达。本研究为进一步研究美洲狼尾草GATA转录因子的

功能及调控机制提供了理论依据和指导。

关键词：美洲狼尾草；GATA转录因子；生物信息学分析；非生物胁迫

中图分类号：S543.9文献标识码：A文章编号：1007-0435（2025）02-0391-10

BioinformaticsAnalysisofGATAFamilyofPennisetumglaucum

111111，2*

LUOLi-xuan，ZHOUTao，XUQian，LURui，LIUNing-fang，HULong-xing

（1.DepartmentofPrataculturalScience，CollegeofAgronomy，HunanAgriculturalUniversity，Changsha，HunanProvince410128，China；

2.AcademicianWorkstationofAgriculturalHigh-techIndustrialAreaoftheYellowRiverDelta，National