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实验动物代谢组学特征解析与生物标志物筛选

目录

文档简述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1.1实验动物模型在疾病研究中的应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.1.2代谢组学技术在生命科学研究中的价值．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

1.2.1实验动物代谢组学研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

1.2.2生物标志物筛选与验证技术发展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

1.3.1主要研究目的．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

1.3.2具体研究内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

实验动物与样本采集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

2.1实验动物模型的选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

2.1.1动物种属与品系的选择依据．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

2.1.2动物模型构建与标准化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

2.2样本采集与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

2.2.1血液、尿液、粪便等生物样本采集方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

2.2.2样本保存、预处理与储存．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

代谢组学分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

3.1溶液质谱分析技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

3.1.1便携式质谱仪原理与应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

3.1.2溶液质谱数据采集与预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

3.2固相萃取与样品前处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

3.2.1固相萃取原理与方法优化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

3.2.2样品衍生化技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

代谢组学数据解析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

4.1数据预处理与峰识别．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

4.1.1质谱数据峰提取与对齐．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

4.1.2基于公共数据库的代谢物鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

4.2多变量统计分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

4.2.1基于偏最小二乘判别分析的方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

4.2.2代谢通路分析与网络构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

4.3代谢物丰度变化分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

4.3.1差异代谢物的筛选与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

4.3.2代谢物变化模式可视化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48

生物标志物筛选与验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51

5.1生物标志物候选分子的筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52

5.1.1基于统计分析的标志物筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．53

5.1.2基于机器学习的标志物识别．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54

5.2生物标志物验证方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．55

5.2.1