生物信息学:蛋白质结构预测_(9).基于折叠识别的蛋白质结构预测.docx

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基于折叠识别的蛋白质结构预测

1.折叠识别的基本概念

折叠识别(FoldRecognition)是一种蛋白质结构预测的方法,主要应用于已知蛋白质序列但未知结构的情况。这种方法基于这样一个假设:自然界中的蛋白质结构是有限的,大多数蛋白质序列可以映射到已知的结构模板上。通过将未知蛋白质序列与已知结构的蛋白质序列进行比对,可以找到相似的结构模板,进而预测未知蛋白质的三维结构。折叠识别通常分为两个主要步骤:模板搜索和模型构建。

1.1模板搜索

模板搜索是折叠识别的第一步,其目的是在已知结构的蛋白质数据库中找到与目标蛋白质序列相似的结构模板。常用的数据库包括

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