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分子植物育种,2024年,第22卷,第2期,第543-551页
MolecularPlantBreedirNo.2,543-551
研究报告
ResearchReport
金柑种质的特异性SSR标记筛选及亲缘关系分析
吴娟莉杨柳易自力黄红梅*
湖南农业大学生物科学技术学院,长沙,410125
*通信作者,hhm7418@163.com
要为筛选金柑属植物的特异性SSR标记,解决金柑属植物的同物异名或同名异物问题。本研究选取
摘要
92.99%,扩增得到的片段在100~1200bp之间不等;SSR标记筛选得到47个特异性标记,不同种质之间的
特异标记数量差别较大,最多的公孙桔达到7个特异性标记,柑橘属及积属种质均可被标记,而无特异性标
记的11份种质均为金柑属;聚类分析发现,金柑属与柑橘属、积属的遗传相似系数均在0.70以上,这表明金
柑属与积属、柑橘属均有很近的亲缘关系。在相似系数为0.902处,未找到特异性标记的11份金柑属种质聚
在一起,这也表明金柑属各品种亲缘关系及近,存在同物异名或同名异物。
关键词金柑;SSR标记;亲缘关系
ScreeningofKumquatGermplasmwithSpecificSSRMarkersandAnalysis
ofGeneticRelationship
WuJuanliYangLiuYiZiliHuangHongmei
CollegeofBioscienceandBiotechnology,HunanAgriculturalUniversity,Changsha,410125
*Correspondautholhhm7418@163.com
DOI:10.13271/j.mpb.022.000543
AbstractInordertoscreenthespecificSSRmarkersandsolvetheproblemofsynonymandhomonymof
kumquatplants.Inthisstudy,38samplesofkumquatanditsrelatedgenerawereselectedandamplifiedby23
pairsofprimerstoobtain265effectivebands,250polymorphicbands,andthepolymorpnismratiowas92.99%.
Theamplifiledfragmentwasfrom100to1200bp.SSRmarkerscreeningresultedin47specificmarkers.Thenum-
berofspecificmarkersdifferedgreatlybetweendifferentgermplasms.ThemostGongsongjureached7specific
markers.CitrusandPoncirusgermplasmscouldbelabeledwithoutspecificity.The11germplasmsidentifiedby
themarkerarearealloftheFortunella.ClusteranalysisfoundthatthegeneticsimilaritycoefficientsofFortunella,
CitrusandPoncirusareallabove0.70,whichindicatesthatFortunellaarecloselyrelatedtoplantsofCitrusand
Poncirus.Atthesimilaritycoefficientof0.902,the11germplasmswithnospecificmarkerswereclusteredtogether,
whichalsoshowedthatthephylogeneticrealtionshipofthekumquatcultivarswasclose,andthereexistedthesyn-
onymandhomonym.
KeywordsKumquat;SSRmarker
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