第五节数量性状基因座.ppt

第1页，共22页，星期日，2025年，2月5日质量性状和数量性状的区别质量性状数量性状①．变异类型种类上的变化（如红、白花）数量上的变化（如种子产量）②．表现型分布不连续连续③．基因数目一个或少数几个微效多基因④．对环境的敏感性不敏感敏感⑤．研究方法系谱和概率分析统计分析第2页，共22页，星期日，2025年，2月5日前言经典数量遗传分析法分析控制数量性状表现的众多基因的综合遗传效应，但是无法鉴别基因的数目、单个基因在染色体上的位置和遗传效应。作物分子标记+数量性状基因座（QTL）定位分析法确定影响某一数量性状的基因在染色体上的数目、位置及其遗传效应。第3页，共22页，星期日，2025年，2月5日第五节数量性状基因座一、QTL定位的原理和步骤二、QTL定位的统计方法三、QTL分析的应用前景第4页，共22页，星期日，2025年，2月5日一、QTL定位的原理和步骤QTL（quantitativetraitloci）：全称数量性状基因座，它指的是控制数量性状的基因在基因组中的位置。QTL定位：也称QTL作图；借助分子标记，可以在染色体上检测出QTL，并可以确定影响某一数量性状的QTL在染色体上的数目、位置和遗传效应。第5页，共22页，星期日，2025年，2月5日QTL定位的原理如果分子标记覆盖整个基因组，控制数量性状的基因(Qi)两侧会有相连锁的分子标记(Mi-?和Mi+?),这些与Qi紧密连锁的分子标记将表现不同程度的遗传效应。利用分子标记定位QTL（Qi），实质就是分析分子标记与数量性状基因座Qi的连锁关系，即利用已知座位的分子标记来定位未知座位的Qi，通过分子标记与Qi之间的重组率，来确定Qi的具体位置。第6页，共22页，星期日，2025年，2月5日图8-5QTL定位的基本原理示意图单标记和单基因MQ不连锁MQ连锁第7页，共22页，星期日，2025年，2月5日构建作图群体确定和筛选遗传标记检测分离世代群体中每一个体的标记基因型测量数量性状统计分析QTL定位的步骤第8页，共22页，星期日，2025年，2月5日QTL定位的步骤（1）构建作图群体适于QTL作图的群体是待测数量性状存在广泛变异，多个标记位点处于分离状态的群体。一般是由亲缘关系较远的亲本间杂交，再经自交、回交等方法构建。常用的群体有F2群体、回交（BC）群体、双单倍体（doubledhaploids,DH）群体，重组近交系（recombinantinbredlines,RIL）群体等。其中DH群体和RIL群体可以永久使用。第9页，共22页，星期日，2025年，2月5日QTL定位的步骤（2）确定和筛选遗传标记理想的作图标记应具备以下4个特征：数量丰富多态性好中性共显性形态学标记（morphologicalmarker）蛋白质标记(proteinmarker)分子标记(molecularmarker)：或DNA标记。第10页，共22页，星期日，2025年，2月5日常用的分子标记中文名称英文名称英文缩写限制性长度片段多态性RestrictionfragmentlengthpolymorphismRFLP扩增片段长度多态性AmplifiedfrangmentlengthpolymorphismAFLP随机扩增多态DNARandomamplifiedpolymorphismDNARAPD可变数目串联重复VariablenumberoftandemrepeatVNTR微卫星（简单序列重复）SimplesequencerepeatSSR第11页，共22页，星期日，2025年，2月5日QTL定位的步骤（3）检测分离世代群体中每一个体的标记基因型用多态性分子标记检测分离世代群体中每一个体（系）的标记基因型值。各种分子标记最后显示的都是电泳分离的带谱，所以个体的标记基因型需要将每个标记的带纹与亲本比较并赋值来记录，例如在共显性情况下，作图群体中应含有P1，P2和杂合型3种带型，这3种带型即代表某