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;;;11.1.1数据变换;1.中心化处理;2.规格化变换;3.标准化变换;11.1.2样本(或指标)间亲疏程度的测度计算;1.常用距离的计算;2.相似系数的计算;11.1.3scipy.cluster.hierarchy模块的系统聚类;1.linkage;2.fcluster;3.H=dendrogram(Z,p)
;11.1.4基于类间距离的系统聚类;1.最短距离法;#程序文件ex11_1_1.py
importscipy.cluster.hierarchyassch
importnumpyasnp
importpylabasplt
?
plt.rc(text,usetex=True);plt.rc(font,size=16)
a=np.array([[2,3,3.5,7,9]]).T
c=sch.linkage(a)
s=[$\\omega_+str(i+1)+$foriinrange(5)]
sch.dendrogram(c,labels=s);plt.show()
;使用距离聚类的Python程序如下:
#程序文件ex11_1_2.py
importscipy.cluster.hierarchyassch
importpylabasplt
?
plt.rc(text,usetex=True);plt.rc(font,size=16)
a=[2,3,3.5,7,9];n=len(a)
d=[abs(a[i]-a[j])foriinrange(n-1)forjinrange(i+1,n)]
c=sch.linkage(d)
s=[$\\omega_+str(i+1)+$foriinrange(n)]
sch.dendrogram(c,labels=s);plt.show();#程序文件ex11_2.py
importnumpyasnp
importscipy.cluster.hierarchyassch
importpylabasplt
?
plt.rc(text,usetex=True);plt.rc(font,size=16)
a=np.loadtxt(data11_2.txt);n=a.shape[0]
b=(a-a.min(axis=0))/(a.max(axis=0)-a.min(axis=0))
z=sch.linkage(b)
s=[$\\omega_+str(i+1)+$foriinrange(n)]
sch.dendrogram(z,labels=s);plt.show();2.最长距离法;#程序文件ex11_3.py
importnumpyasnp
importscipy.cluster.hierarchyassch
importpylabasplt
?
plt.rc(text,usetex=True)
a=np.array([[2,3,3.5,7,9]]).T;n=len(a)
c=sch.linkage(a,complete,mahalanobis)
s=[$\\omega_+str(i+1)+$foriinrange(n)]
sch.dendrogram(c,labels=s);plt.show()
n0=eval(input(请输入聚类的类数n0:\n))
cluster=sch.fcluster(c,t=n0,criterion=maxclust)
print(聚类的结果为:,cluster);3.其他系统聚类方法;11.1.5动态聚类法;#程序文件ex11_4.py
importnumpyasnp
fromsklearn.clusterimportKMeans
?
a=np.array([[1,3],[1.5,3.2],[1.3,2.8],[3,1]])
md=KMeans(2).fit(a)#构建2聚类模型并求解
labels=md.labels_#提取聚类标签
centers=md.cluster_centers_#每一行是一个聚类中心
print(labels,\n-----------\n,centers);#程序文??ex11_5.py
importnumpyasnp
fromsklearn.clusterimportKMeans
?
a=np.array([[2,3,3.5,7,9]]).T
md=KMeans(2).fit(a)#构造并求解模型
labels=md.labels_
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