不同种植物中HMGR基因的生物信息学分析.pdfVIP

山西农业科学2025，53（3）：27-43JournalofShanxiAgriculturalSciences

李娜，樊裕璇，韩红艳，等.不同种植物中HMGR基因的生物信息学分析[J].山西农业科学，2025，53（3）：27-43.

LIN，FANYX，HANHY，etal.BioinformaticsanalysisofHMGRgenesindifferentplants[J].JournalofShanxiAgriculturalSci⁃

ences，2025，53（3）：27-43.

doidoi:10.3969/j.issn.1002-2481.2025.03.04

不同种植物中HMGR基因的生物信息学分析

111221

李娜，樊裕璇，韩红艳，宋宇琴，李六林，赵红梅

（1.晋中学院生物科学与技术系，山西晋中030609；2.山西农业大学园艺学院，山西晋中030801）

摘要：为鉴定不同种植物中的HMGR（3-Hydroxy-3-methylglutarylcoenzymeAreductase）基因，采用生物信

息学方法分析拟南芥、番茄、马铃薯等18种植物中HMGR蛋白的理化性质，并对其跨膜结构、亚细胞定位、修饰

位点等特性进行分析，预测18种植物HMGR基因编码蛋白的高级结构和保守结构域。结果表明，甜瓜HMGR

蛋白序列最长，由1244个氨基酸组成，草莓HMGR蛋白序列最短，由131个氨基酸组成；玉米HMGR蛋白的等

电点最高，为10.12，草莓HMGR蛋白的等电点最低，为4.72；除芒果、玉米、小麦、杨树和桃HMGR蛋白带正电

荷之外，其余植物均带负电荷。除玉米、杨树、草莓之外，其余植物的脂肪族指数均在90以上，推断HMGR大多

为疏水蛋白；HMGR蛋白在芒果中最稳定，在梨和杏中的最强疏水性最高，在杨树中的最强亲水性最高；除草

莓外，其余植物中的HMGR都具有跨膜结构，其中甜瓜跨膜结构位置最多。对蛋白质修饰位点的分析结果显

示，草莓中的HMGR蛋白的糖基化位点数量最少，杏的糖基化修饰位点最多，拟南芥的磷酸化位点数量最多，

草莓的磷酸化位点数量最少，二级结构主要由α-螺旋和无规卷曲构成。HMGR基因基本被分为3类，且除玉米

外，17种植物HMGR蛋白均包含HMG-CoAreductaseClassⅠ结构域。

关键词：HMGR基因；生物信息学；理化性质；基因编码蛋白；保守结构域

中图分类号Q943.2文献标识码A文章编号1002‒2481（2025）03‒0027‒17

：：：

BioinformaticsAnalysisofHMGRGenesinDifferentPlants

111221

LINa，FANyuxuan，HANHongyan，SONGYuqin，LILiulin，ZHAOHongmei

（1.DepartmentofBiologicalScienceandTechnology，JinzhongUniversity，Jinzhong030609，China；

2.Colleg