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第42卷第6期中华中医药学刊Vol.42No.6
2024年6月CHINESEARCHIVESOFTRADITIONALCHINESEMEDICINEJun.2024
DOI:10.13193/j.issn.16737717.2024.06.036
基于加权基因共表达网络分析
识别肥胖型多囊卵巢综合征的关键基因
12344
张丽娜,姜晓琳,侯海燕,柯妍,宋小磊
(1.辽宁中医药大学教学实验中心,辽宁沈阳110847;2.辽宁中医药大学中医药
创新工程技术中心,辽宁沈阳110847;3.中国人民武装警察部队后勤学院附属医院,天津300162;
4.广州中医药大学附属深圳市中西医结合医院,广东深圳518104)
摘要:目的采用加权基因共表达网络分析(weightedgeneco-expressionnetworkanalysis,WGCNA)方法识别肥胖型
多囊卵巢综合征(polycysticovarysyndrome,PCOS)的关键基因,探讨肥胖型PCOS的发病机制。方法从基因表达数据库
(geneexpressionomnibus,GEO)下载GSE5090芯片数据,通过WGCNA算法分析筛选基因共表达关键模块和核心基因,
对关键模块进行GO和KEGG分析,对核心基因进行差异分析以确定肥胖型PCOS的关键基因。结果在GSE5090芯片
数据中,通过WGCNA分析构建出了31个共表达基因模块,其中重褐色模块(MEsaddlebrown)与肥胖型PCOS具有密切
的相关性,包含53个基因。对此模块基因进一步筛选,识别出了ZNF492、MED17、CRABP1、KCNV2、KRI1、ACSBG2、MA
CO1、SCLY、CPSF1、MAGEA810个肥胖型PCOS核心基因。对此模块基因进行GO和KEGG分析发现相关基因与脂肪酸
代谢关系密切,主要作用于核蛋白,通过调节染色体组织、有机酸分解等发挥生物学功能。进一步对核心基因表达量进
行差异分析,基因ZNF492、CRABP1、KCNV2在肥胖对照组与肥胖型PCOS脂肪组织间存在明显差异。结论ZNF492、
CRABP1和KCNV2基因在肥胖型PCOS的发展中可能产生重要生物学意义,其具体机制有待进一步研究。
关键词:多囊卵巢综合征;加权基因共表达网络;差异表达基因;GO分析;KEGG分析
中图分类号:R271.1文献标志码:A文章编号:16737717(2024)06017908
IdentificationofkeygenesinobesepolycysticovarysyndromeonWGCNA
12344
ZHANGLina,JIANGXiaolin,HOUHaiyan,KEYan,SONGXiaolei
(1.TeachingandExperimentalCenter,LiaoningUniversityofTraditionalChineseMedicine,Shenyang110847,Liaoning,China;
2.ChineseMedicineInnovationEngineeringTechnologyCenter,LiaoningUniversityof
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