动物基因组学：蛋白质结构预测_（11）.计算生物学工具与软件.docx

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计算生物学工具与软件

1.引言

计算生物学是生物信息学的一个重要分支，它利用计算机科学、数学和统计学的方法来解决生物学问题。在动物基因组学研究中，计算生物学工具和软件的应用尤为广泛，从基因组组装、注释到功能预测，再到蛋白质结构预测，这些工具和软件为研究者提供了强大的支持。本节将重点介绍一些常用的计算生物学工具和软件，特别是那些在蛋白质结构预测中发挥关键作用的工具。

2.常用计算生物学工具

2.1基因组组装工具

基因组组装是将短读长测序数据拼接成完整的基因组序列的过程。常用的基因组组装工具有：

SPAdes：适用于细菌和病毒基因组的组装。

Canu：