23andme个体基因组报告内容结果计算介绍.pdfVIP

23andme个体基因组报告内容结果计算介绍.pdf

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#资讯#23andMe组报告内容和结果计算介绍

知因无限

组的概念现下愈发火热,为了解组报告中一些

主要元素组成以及相关结果的计算方式。蜀黍独自奋战,把23andMe

的组分析报告和资料挖了一遍,东拼西凑总结了如下内容,

如对下文的描述有不同看法,或是文中有概念性错误,希不吝赐教

()。

23andMe报告内容组成

结合当前搜集到的各种资料,23andMe提供的组检测报

告主要分为5个内容,分别为祖源分析、一般性状、药物反应、疾病

易感位点携带筛查、疾病患病风险。就蜀黍个人而言,更关注于一般

性状、药物反应、疾病易感位点携带筛查、疾病患病风险这4个部分

所提供的检测结果以及相关的实现过程。

23andMe版报告各部分内容组成如下表所示。其中,最为关

键的结果包括关联分析可信度、用户型对应患病风险、平均患病

风险、与平均风险相对变化这四项。

结果内容组成

祖源分析分为层面、父系、母系三类进化分析结

一般性状(Traits)包括性状名称、关联分析可信度、用户型

对应性状特征的具体描述

药物反应(包括药物名称、关联分析可信度、用户型

Drug

Response)对应药物敏感程度

疾病易感位点携带筛包括疾病名称、关联分析可信度、用户型

查(CarrierStatus)是否携带疾病易感位点

疾病患病风险包括疾病名称、关联分析可信度、用户型

(DiseaseRisks)对应患病风险、平均患病风险、与平均风险相

对变化

各项分析结果所涉内容的计算过程

1、关联分析可信度(Confidence)

23andMe报告中关联分析可信度均基于GWAS的分析结果,并使

用不同数量的“★”标识,“★”数量越多,该类疾病检测结果的可信

程度越高。报告中,最为常见的是4星和3星标识,分别对应Established

Reports和PreliminaryReports的GWAS分析结果,这两类GWAS分析

结果的不同之处主要在于所纳入研究的样本个数。但是,23andMe具

体是如何区分EstablishedReports和PreliminaryReports,尚不完全清楚。

2、用户型患病风险和平均患病风险(YourRiskAvg.Risk)

当单个疾病包含EstablishedReports时,23andMe针对这些Reports

的分析结果,如实计算用户

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