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JOURNALOFLI-SHIZHENTRADITIONALCHINESEMEDICINE2025VOL.36NO.3时珍国医国药2025年第36卷第3期

资源开发

基于转录组技术的铁皮石斛CDDP分子

标记开发及抗寒性遗传多样性分析

任得强，王小仲，胡晓，陈宏宇，陈春伶

（贵州中医药大学药学院，贵州贵阳550025）

【摘要】目的基于转录组技术开发CDDP分子标记，解析铁皮石斛抗寒性遗传多样性，可为后续抗寒种质资源的筛选提供

参考。方法设置铁皮石斛低温（0℃）试验，以常温处理组为对照进行转录组学分析，获取铁皮石斛抗寒性相关功能基因并

开发的CDDP分子标记，对来自浙江、云南的栽培种铁皮石斛进行抗寒种质资源鉴定，使用NTSYS、Popgen32、Structure等软

件进行遗传分析。结果铁皮石斛低温胁迫试验转录组测序得到46.85Cb数据，共有1815个差异表达基因参与铁皮石斛

低温胁迫响应,其中1281个基因上调表达,534个基因下调表达。根据抗寒性相关差异表达基因设计了251对CDDP引

物，共筛选出29对多态性引物，扩增得到185条清晰的条带，平均每条引物扩增6.38条带。多态性条带共178条，条带的

多态率（PPL)为96.22%。遗传分析结果表明，供试铁皮石斛具有丰富的遗传变异。群体结构分析表明，该研究中铁皮石

斛种质资源可分成6个亚群。结论贵州栽培种铁皮石斛抗寒性遗传变异丰富，CDDP分子标记可以有效应用于铁皮石斛

遗传多样性分析中。

【关键词】铁皮石斛；转录组；CDDP分子标记；遗传多样性

D0I:10.70976/j.1008-0805.SZGYGY-2025-0331

CSTR:32392.14.j.1008-0805.SZGYGY-2025-0331

【中图分类号】R282.2【文献标识码】A【文章编号】1008-0805（2025）03-0565-06

铁皮石斛（DendrobiumofficinaleKimuraetMi-选择中。CDDP分子标记技术为DNA保守序列多态

go）是贵州省重点发展的中药民族药大品种,对生长性标记[6],最早应用于水稻种质资源筛选中，可以克服

环境要求严苛，喜温暖湿润气候和半阴半阳的环境，不常规育种中种质资源筛选周期长、工作量大和成本高

耐低温[2]。贵州省是铁皮石斛的原产区之一，与安徽、的限制，快速筛选种质资源，越来越受重视。罗铭

浙江省、云南种植多采用设施栽培技术不同，生产上多欣[7]、隽逸豪[8]等研究表明，CDDP引物的高度保守性

采用仿野生树栽生态栽培技术生产，遭遇低温、寒害天能够在不同植物间通用，同时具有快速可靠、操作简

气时，较难采取有效防护措施。贵州省气候不稳定，受便、引物设计简单和实验费用少等优点。吴永辉[9]利

大气环流及地形等影响，灾害性天气类型多样，低温，用CDDP分子标记技术对铁皮石斛进行遗传多样性分

冰和春寒等发生频率高，给铁皮石斛造成了生理严析和抗寒铁皮石斛种质资源筛选，证明了CDDP分子

重危害，低温不仅造成铁皮石斛产量和品质下降，还影标记技术的有效性。

响到来年的生产[3]。因而，低温是制约贵州省铁皮石因此，本项研究旨在设计铁皮石斛低温胁迫试验，

斛推广的最主要因素进行转录组测序，探明低温胁迫下铁皮石斛特异表达

提高铁皮石斛的抗寒性以降低低温伤害是石斛产的相关基因,设计CDDP分子标记,以解析铁皮石斛种

业“提质增效”和进一步推广扩大的关键，而获得高抗质资源抗寒性遗传多样性，以为铁皮石斛耐寒育种提

寒性的铁皮石斛品种则是解决该问题的有效方法[4]供参考。

随着测序技术和手段的不断发展，转录组测序技术已

成为研究作物抗逆应激反应常用的手段[5],并可在此1材料与方法

基础上对控制重要性状的基因进行研究,解析非生物供试材料收集于贵州、云南、四川、广西等省份，凭证

胁迫生理响应机制，验证关键基因功能，并设计目标分标本经贵州中医药大学中药栽培教研室主任魏升华教授

子标记，应用于后续遗传多样性分析及分子标记辅助鉴定，为兰科石斛属铁皮石斛，样品及凭证标本存放于贵

收稿日期：2024-07-14；修订日