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山东农业科学2024ꎬ56(6):1~6ShandongAgriculturalSciences
-
DOI:10.14083/j.issn.10014942.2024.06.001
番茄LeGlyⅠ基因的生物信息学特征与表达模式分析
孙晓辉ꎬ张月昌ꎬ蒋健ꎬ石勇志ꎬ孙秀东
(山东农业大学园艺科学与工程学院ꎬ山东泰安271018)
摘要:植物在遭受逆境胁迫时会产生过量的甲基乙二醛(MG)等有毒醛类化合物ꎬ而乙二醛酶系统能帮
助其有效清除过量的MGꎬ其中乙二醛酶Ⅰ(GlyⅠ)是级联反应的第一个酶ꎬ在此过程中发挥了重要作用ꎮ本
研究以野生番茄‘Heinz1706’的幼苗为试材ꎬ克隆了番茄LeGlyⅠ基因ꎬ并对其生物信息学特征、表达模式以及
亚细胞定位进行了分析ꎮ结果表明ꎬLeGlyⅠ的CDS序列全长为489bpꎬ共编码162个氨基酸ꎻLeGlyⅠ蛋白分
-
子式为CHNOSꎬ分子量为17706.05Daꎬ等电点为6.51ꎬ亲水性平均值为0.386ꎬ不稳定系数为
79812262142354
-
39.32ꎬ预测为亲水性稳定蛋白ꎬ含有一个VOClike结构域ꎮLeGlyⅠ的启动子序列中包含多种顺式作用元件ꎬ
包括无氧诱导必需的顺式作用元件、光响应元件、低温响应元件、干旱响应元件以及茉莉酸甲酯、脱落酸、生长
-
素、赤霉素等激素响应元件ꎮ通过qRTPCR分析发现ꎬLeGlyⅠ基因在番茄的根、茎、叶中均有表达ꎬ且在叶中
的表达量最高ꎬ并且其表达水平受氧化胁迫的影响ꎮ亚细胞定位结果显示ꎬLeGlyⅠ蛋白主要在线粒体和细胞
核中发挥功能ꎮ本研究结果可为深入研究LeGlyⅠ基因在番茄抗逆中的功能及其分子机制提供理论依据ꎮ
关键词:LeGlyⅠ基因ꎻ番茄ꎻ生物信息学分析ꎻ氧化胁迫ꎻ基因表达ꎻ亚细胞定位
---
中图分类号:S641.2:Q786文献标识号:A文章编号:10014942(2024)06000106
AnalysisonBioinformaticsCharacteristicsandExpression
PatternofLeGlyⅠGeneinTomato
SunXiaohuiꎬZhangYuechangꎬJiangJianꎬShiYongzhiꎬSunXiudong
(CollegeofHorticultureScienceandEngineeringꎬShandongAgriculturalUniversityꎬTaian271018ꎬChina)
AbstractTheplantmayproduceexcessivetoxicaldehydessuchasmethylglyoxal(MG)whenfacing
adversitystressꎬandglyoxalenzymesystemcaneffectivelycleartheexcessiveMG.GlyoxalaseI(GlyⅠ)as
thefirstenzymeinthecascadereactionplaysanimportantrole.InthisstudyꎬLeGlyⅠgenewassuccessfully
clonedfromthe
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