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污染环境下土壤微生物代谢受抗生素抑制机制研究

目录

内容概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.1.1环境污染问题概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.1.2土壤生态系统的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

1.1.3微生物在土壤环境中的功能．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

1.2.1污染土壤微生物生态变化研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

1.2.2抗生素类污染物环境行为研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

1.2.3化学物质对微生物干扰机制研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

1.3研究目的与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

1.3.1主要研究目标设定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

1.3.2具体研究内容与计划．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

2.1研究区域与环境样品采集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

2.1.1研究区域选取与布点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

2.1.2土壤样品采集方法与保存．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

2.2实验材料与试剂．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

2.2.1主要仪器设备．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

2.2.2实验所用抗生素类型与来源．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

2.2.3土壤微生物分析试剂．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

2.3土壤样品预处理与化学分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

2.3.1样品常规理化性质测定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

2.3.2土壤中抗生素残留检测方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

2.4土壤微生物群落分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

2.4.1微生物总DNA提取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49

2.4.2物种组成高通量测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．53

2.4.3功能基因多样性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

2.5微生物代谢活性测定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．58

2.5.1根据底物降解实验评估代谢潜能．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．59

2.5.2基于代谢产物分析的代谢途径推断．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．61

2.6代谢抑制机制研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．63

2.6.1接触抑制模型构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．64

2.6.2微生物基因表达谱分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．65

2.6.3代谢物互作分析技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．68

2.7数据处理与统计分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．69

2.7.1数据标准化与质控．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．71

2.7.2生物信息学分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．74

2.7.3统计模型构建与验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．76

结果与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．