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西南农业学报2025年38卷5期
950SouthwestChinaJournalofAgriculturalSciencesVol.38No.5
引用格式:
李勒松,李朝会,王娟,梁艳丽,杨生超,栗孟飞,赵艳.当归MYB转录因子家族成员的鉴定与表达分析[J].
963.
LiLS,LiCH,WangJ,LiangYL,YangSC,LiMF,ZhaoY.IdentificationandexpressionanalysisofMYBtranscriptionfactorfamilymembersinAngeli-
casinensis[J].SouthwestChinaJournalofAgriculturalSciences,2025,38(5):950-963.D0I:10.16213/j.cnki.scjas.2025.5.008.
当归MYB转录因子家族成员的鉴定与表达分析
赵艳1,2
李勒松12,李朝会12,王女娟12,梁艳丽,杨生超12栗孟飞”,赵
(1.云南农业大学西南中药材种质创新与利用国家地方联合工程研究中心/云南省药用植物生物学重点实验室/农学与生物技术
学院,昆明650201;2.云南特色植物提取实验室有限公司,昆明650106;3.甘肃农业大学农学院,兰州730070)
摘要:【目的】鉴定药用植物当归(Angelicasinensis转录因子家族成员,研
究其转录组表达模式,筛选可能参与当归中黄酮合成的MYB转录因子。【方法】基于当归全基因组对当归中的MYB家族转录因
子进行鉴定和分析,利用生物信息学手段对153个MYB家族转录因子进行深入探究,包括蛋白理化性质分析、系统进化发育分
析、基因结构解析、保守基序鉴定、保守结构域识别、染色体定位、共线性分析以及顺式作用元件鉴定,并对转录组表达模式进行分
析,筛选出在当归中可能参与黄酮类化合物生物合成的候选MYB家族成员。【结果】当归全基因组水平共鉴定到153个MYB转
录因子,其中1R-MYB亚族有21个,2R-MYB亚族有130个,不含3R-MYB亚族,4R-MYB亚族有2个。153个转录因子的氨基酸长
度为179~451aa,相对分子质量为20.0~50.1kDa,均为亲水性蛋白;亚细胞定位分析表明,绝大多数MYB蛋白呈现典型的核定
位特征,其中仅发现1条MYB表现出在细胞核和细胞质中的双重定位特征;系统发育树分析表明,与拟南芥MYB聚集同一分支上
的转录因子基因结构类似;顺式作用元件预测,发现MYB启动子上具有多种参与生长发育、激素调控以及逆境胁迫的元件。转录
组MYB转录因子的表达模式分析发现,153个MYB中有121个转录因子在当归根和叶不同部位存在差异表达。此外,利用系统
进化分析筛选出9个可能参与当归黄酮生物合成的候选MYB转录因子,选择其中4个转录因子的编码基因进行基因荧光定量,结
果与转录组数据一致。【结论】基于当归全基因组数据鉴定到153个MYB转录因子,其中包含21个1R-MYB亚族成员,130个2R-
MYB亚族成员,2个4R-MYB亚族成员,不包含3R-MYB亚族。RT-qPCR结果表明,AsMYB34、AsMYB79、AsMYB96和AsMYB127可
能参与当归中黄酮醇的合成。
关键词:当归;MYB转录因子;全基因组鉴定;生物信息学分析;基因表达分析
中图分类号:S567文献标志码:A文章编号:1001-4829(2025)5-0950-14
IdentificationandexpressionanalysisofMYBtranscriptionfactor
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专注于经营管理类文案的拟写、润色等,本人已有10余年相关工作经验,具有扎实的文案功底,尤善于各种框架类PPT文案,并收集有数百万份各层级、各领域规范类文件。欢迎大家咨询!
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