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环境适应基因在作物抗逆育种中的应用机制研究

目录

一、文档综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.2国内外研究进展综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

1.2.1环境适应基因的发掘历程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

1.2.2作物抗逆育种的技术演变．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

1.2.3分子机制解析的研究动态．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

1.4技术路线与实验方案．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

1.5本研究的创新点．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

二、环境适应基因的筛选与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

2.1材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

2.1.1实验材料的选择与培育．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

2.1.2抗逆性表型鉴定体系构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

2.1.3基因组学数据的获取与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

2.2候选基因的发掘策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

2.2.1转录组学关联分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

2.2.2全基因组关联扫描．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

2.2.3同源基因比对与功能注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

2.3候选基因的验证与功能初判．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

2.3.1序列特征与保守结构域分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

2.3.2系统发育与进化关系解析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48

三、环境适应基因的抗逆功能解析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51

3.1非生物胁迫响应机制探究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52

3.1.1干旱胁迫下的基因表达调控网络．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．57

3.1.2高盐胁迫离子平衡与渗透调节相关基因．．．．．．．．．．．．．．．．．．58

3.1.3温度胁迫的分子应答路径．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．61

3.2生物胁迫防御机制研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．64

3.2.1病原菌侵染的基因表达谱变化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．65

3.2.2虫害响应的信号传导与代谢调控．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．67

3.3基因功能丧失与过表达验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．71

3.3.1基因编辑技术的应用（如CRISPR/Cas9）．．．．．．．．．．．．．．．．．73

3.3.2转基因植株的表型鉴定与生理指标分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．76

四、环境适应基因的调控网络构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．79

4.1转录因子与靶基因的互作关系．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．80

4.1.1酵母单杂交（Y1H）筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．82

4.1.2染色质免疫共沉淀验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．83

4.2表观遗传修饰在基因调控中的作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．85

4.2.1DNA甲基化与组蛋白修饰分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．86

4.2.2非编码RNA的调控机制探究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．89

4.3信号通路交叉对话与整合．．．．．．．．．．．