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网络药理学评价方法指南

一、概述

网络药理学作为一种新兴的研究领域，融合了生物信学、系统

生物学、药理学和计算机科学等多个学科的知识和技术，旨在揭示药

物与生物系统的相互作用机制。其核心思想是通过构建和分析生物分

子网络，深入理解药物作用的多靶点、多途径特征，从而为药物发现

和精准医疗提供理论依据和实用工具。

在本指南中，我们将详细介绍网络药理学评价方法的原理、流程

和应用。我们将阐述网络药理学的理论基础，包括系统生物学的基本

概念、生物分子网络的构建方法以及网络分析的主要技术。接着，我

们将讨论网络药理学评价方法在实际应用中的关键步骤，如药物靶点

识别、网络构建、网络分析以及结果验证等。我们将通过具体的案例

研究，展示网络药理学评价方法在药物发现和疾病治疗中的重要作用。

1.1网络药理学概述

网络药理学(NetworkPharmacology)作为一种新兴的交叉学科

领域，融合了系统生物学、生物信学、药物化学和分子药理学等多

个领域的理论与技术手段，致力于从整体和系统的角度探索药物的作

用机制。该学科通过构建和分析多层面的生物网络，包括基因调控网

络、蛋白质相互作用网络、代谢通路网络以及疾病相关的生物网络等,

来揭示药物对复杂生物系统的影响及其潜在治疗效果。

网络药理学的核心理念在于，许多传统中药及现代药物具有多成

分、多靶点的特点，它们并非针对单一靶点发挥作用，而是通过调节

多个相关生物靶点之间的交互关系来实现复杂的治疗效应。网络药理

学方法不仅能够用于新药研发，提高药物设计的精准度与效率，还能

够对已知药物的复方配伍、作用机制、副作用预测以及个性化用药等

方面提供深入理解与指导。

在网络药理学研究中，研究人员通常首先建立药物靶点相互作用

网络，进而扩展至靶点所在的生物网络中，探究药物如何通过干预这

些网络中的关键节点和通路来影响疾病的发生发展过程。这种方法论

的引入，极大地丰富了我们对药物作用复杂性的认知，并为药物发现

和合理用药提供了全新的视角和策略。

定义与起源

网络药理学，作为一种新兴的交叉学科领域，融合了系统生物学、

网络科学、计算机科学以及药物研发等多个学科的知识与技术。其核

心理念在于，利用复杂网络的分析方法，深入探索生物分子网络（如

蛋白质互作网络、基因调控网络等）与药物之间的相互作用及其机制,

进而为药物研发提供更为精准和高效的理论依据和实践指导。

网络药理学的起源可追溯至上世纪末，随着人类基因组计划的完

成，大量生物分子数据得以积累。科学家们逐渐意识到，单一的分子

或基因研究已难以全面揭示生命活动的复杂性。一个全新的研究式

——网络药理学应运而生。该方法强调从整体和系统的视角出发，全

面分析生物网络中的多分子交互，以及这些交互如何影响疾病的发生、

发展，并如何被药物所调控。

发展历程与研究意义

《网络药理学评价方法指南》的发展历程可以追溯到2021年3

月9日，当时世界中医药学会联合会认证通过了该指南。这是中医药

领域第一个正式制定的关于新兴学科的国际标准，标志着中医药原创

研究在引领交叉学科国际发展方面迈出了关键一步。该指南的制定旨

在提供一套全面、实用的方法，以引导研究者有效地进行网络药理学

研究。

网络药理学是人工智能和大数据时代药物系统性研究的新兴、交

又、前沿学科。它强调从系统层次和生物网络的整体角度出发，解析

药物及治疗对象之间的分子关联规律。这一学科被广泛应用于药物和

中药活性化合物发现、整体作用机制阐释、