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关于Chromas使用说明:
Chromas应用程序可以用来查看和编辑的峰形图,图谱文件一般为SCF格式(*.scf),
您一般所收到的email和报告的磁盘中的图谱文件一般都是SCF格式的,此软件的主要
使用方法如下:
打开email后,把附件中的所有文件保存到硬盘,先阅读使用说明,然后运行Chromas
补丁文件,接着双击打开Chromas应用程序,图1为打开Chromas后的程序界面。
图1
1.点击菜单栏上的“File”中的“Open”或点击上的“Open”按钮,打开文件。
如图2,找到您存放email结果的目录,选中一个图谱文件(在此以图谱A为例)。
图2
2.打开了图谱文件以后,窗口内显示的是结果的峰形图.
如图3。由于仪器或其它一些结果会有一些误差。
双脱氧终止法是从引物3端第一个碱基开始.没有的引物序列.
时,由于荧光的干扰,结果在引物3端后面的10至30个,严重时可能达
到70个以上碱基不一定能够准确判读,需你根据自己的已知序列信息及彩图作出判断
如图在第一个位置处漏读了一个A,在第五和第六个碱基中间,仪漏读了一个A
碱基,第二个碱基仪把C和A两个碱基为一个N值等。由于单体的干扰和迁
移率的,这些问题较多的发生在序列的起始的部分。这些机器造成的错误可以人为的把
其校正修改过来。图4为修改后的序列图谱。
但并不是所有的N值都可以校正,在此以PCR样品的B序列图谱为例,如图5,此序
列在79bp后许多地方有N值,由于样品突变的,该序列中明显包含两种模板,因此有
两套峰,这些N值是不能正确校正的,只能将该样品进行克隆后进序。
由于胶体迁移率的,一般的样品在500bp后峰形会有所变差,这样只能根据峰
形作适当的修改,随着往后的峰形越差,能辨别的程度也就越低,若要确切的知道后面的序
AboutChromasInstructions:
Chromasapplicationscanbeusedtoviewandeditthepeakgraphof.Thegraphfiare
generallyinSCFformat(*.scf).Thegraphfionthediskoftheemailandsequencingreportsyou
generallyreceivearegenerallyinSCFformat.Themainusagemethodsofthissoftwareareasfollows:
Afteropeningemail,saveallthefiintheattachmenttotheharddisk,readtheinstructionsforuse
first,thenruntheChromaspatchfile,andthendouble-clicktoopentheChromasapplication.Figure1sho
wstheprograminterfaceafteropeningChromas.
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