生物化学复习-蛋白质.pptxVIP

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生物化学复习-蛋白质;第一节蛋白质的元素组成;方法:常用6mol/L的盐酸或4mol/L的硫

酸,回流煮沸时间约20h。

优点:不引起消旋作用,得到的是L-氨基酸。

缺点:色氨酸被沸酸完全破坏;含有羟基的氨

基酸(丝氨酸、苏氨酸)有一小部分

被分解;天冬酰胺和谷氨酰胺的酰胺基

被水解成了羧基。;2.碱水解;3.酶水解;二、氨基酸的功能:

;

;

;α-氨基酸的一般结构

氨基在α-位,为L-构型.;氨基酸的分类;R基均为中性烷基(Gly为H),R基对分子酸碱性影响很小,它们几乎有相同的等电点。(6.0±0.03)

Gly是唯一不含手性碳原子的氨基酸,因此不具旋光性。

从Gly至Ile,R基团疏水性增加,Ile是这20种a.a中脂溶性最强的之一(除Phe2.5、Trp3.4、Tyr2.3以外)。;丝氨酸(Ser,S);含羟基的有两种:Ser和Thr

Ser的-CH2OH基(pKa=15),在生理条件下不解离,但它是一个极性基团,能与其它基团形成氢键,具有重要的生理意义。在大多数酶的活性中心都发现有Ser残基存在。

Thr中的-OH是仲醇,具有亲水性,但此-OH形成氢键的能力较弱,因此,在蛋白质活性中心中很少出现。

Ser和Thr的-OH往往与糖链相连,形成糖蛋白。

含硫的两种:Cys、Met

Cys中R含巯基(-SH),Cys具有两个重要性质:

(1)在较高pH值条件,巯基离解。

(2)两个Cys的巯基氧化生成二硫键,生成胱氨酸

(Cys—s—s—Cys)

;二硫键在蛋白质的结构中具有重要意义。

Cys还常常出现在酶的活性中心。

Met的R中含有甲硫基(-SCH3),硫原子有亲核性,易发生极化,因此,Met是一种重要的甲基供体。

Cys与结石

在细胞外液如血液中,Cys以胱氨酸(Cystine)氧化形式存在,胱氨酸的溶解性最差。

胱氨酸尿(Cystinuria)是一种遗传病,由于胱氨酸的跨膜运输缺陷导致大量的胱氨酸排泄到尿中。胱氨酸在肾(Kidney)、输尿管(ureter)、膀胱(urinarybladder)中结晶形成结石(Calculus,calculi),结石会导致疼痛、发炎甚至尿血。

大量服用青霉胺(Penicillcemine)能降低肾中胱氨的含量,因为青霉胺与半胱氨酸形成的化合物比胱氨酸易溶解。;;Asp、Glu,一般称酸性??基酸

Asp侧链羧基pKa(β-COOH)为3.86,Glu侧链羧基pKa(γ-COOH)为4.25

它们是在生理条件下带有负电荷的仅有的两个?氨基酸。

Asn、Gln

酰胺基中氨基易发生氨基转移反应,转氨基反应在生物合成和代谢中有重要意义;碱性氨基酸

;Lys的R侧链上含有一个氨基,侧链氨基的pKa为10.53。生理条件下,Lys侧链带有一个正电荷(—NH3+),同时它的侧链有4个C的直链,柔性较大,使侧链的氨基反应活性增大。(如肽聚糖的短肽间的连接)

Arg是碱性最强的氨基酸,侧链上的胍基是已知碱性最强的有机碱,pKa值为12.48,生理条件下完全质子化。;His含咪唑环,咪唑环的pKa在游离氨基酸中和在多肽链中不同,前者pKa为6.00,后者为7.35,它是20种氨基酸中侧链pKa值最接近生理pH值的一种,在接近中性pH时,可离解平衡。它是在生理pH条件下唯一具有缓冲能力的氨基酸。

His含咪唑环,一侧去质子化和另一侧质子化同步进行,因而在酶的酸碱催化机制中起重要作用。

;2、芳香族氨基酸;都具有共轭π电子体系,易与其它缺电子体系或π电子体系形成电荷转移复合物(charge-transfercomplex)或电子重叠复合物。在受体—底物、或分子相互识别过程中具有重要作用。

这三种氨基酸在近紫外区有特殊吸收峰,蛋白质的紫外吸收主要来自这三种氨基酸,在280nm处,Trp>Tyr>Phe。

Phe疏水性最强.。

酪氨酸的-OH磷酸化是一个十分普遍的调控机制,Tyr在较高pH值时,酚羟基离解。

Trp有复杂的π共轭休系,比Phe和Tyr更易形成电荷转移络合物。;3、杂环氨基酸;Pro,有时也把His、Trp归入此类。

Pro是唯一的一种环状结构的氨基酸,它的α-亚氨基是环的一部分,因此具有特殊的刚性结构。它在蛋白质空间结构中具有极重要的作用,一般出现在两段α-螺旋之间的转角处,Pro残基所在的位置必然发生骨架方向的变化;2.按R基的极性分类(能否与水形成氢键);3、极性带正电荷的氨基

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