基于普通转录组和孟德尔随机分析探讨肾透明细胞癌中PANoptosis相关基因的诊断价值.pdfVIP

AdvancesinClinicalMedicine临床医学进展,2024,14(4),156-173

PublishedOnlineApril2024inHans./journal/acm

/10.12677/acm.2024.1441001

基于普通转录组和孟德尔随机分析探讨肾透明

细胞癌中PANoptosis相关基因的诊断价值

12221*

王智超，仇梦真，高兴华，高相芹，张龙洋

1山东大学附属济南市中心医院泌尿外科，山东济南

2山东第一医科大学附属中心医院泌尿外科，山东济南

收稿日期：2024年3月1日；录用日期：2024年3月25日；发布日期：2024年4月3日

摘要

肾透明细胞癌(KIRC)是一种常见的泌尿生殖系统恶性肿瘤，但其早期发现和诊断相当困难。泛凋亡

(PANoptosis)强调细胞焦亡、细胞凋亡和坏死之间的作用和协调。本研究的目的是通过孟德尔随机分析

方法(MR)，确定PANoptosis相关基因(PRG)在KIRC中的作用，并揭示其因果关系。通过对3446个差异

表达基因(DEGs)和347个PRGs进行交叉分析，我们发现66个差异表达的PANoptosis相关基因(DE-PRGs)

存在表达量性状位点(eQTL)。分别进行双样本单变量和多变量MR分析后发现，PRF1(P=0.030，OR95%

置信区间[CI]=1.599[1.047~2.441])、TNFRSF10B(P=0.008,OR95%CI=1.238[1.058~1.447])、

PDGFRB(P=0.012,OR95%CI=0.546[0.340~0.876])基因与KIRC疾病有关，以上3个标记基因同时

存在时，PDGFRB基因是一个直接因素。此外，基于生物信息学分析，建立了具有良好诊断价值的KIRC

模型。最后，通过数据分析和实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证标记基因的表达。

关键词

肾脏透明细胞癌(KIRC)、泛凋亡相关基因(PRG)、差异表达基因(DEG)、孟德尔随机化(MR)分析、诺模图

ExploringtheDiagnosticValueof

PANoptosis-RelatedGenesinKidneyRenal

ClearCellCarcinomaBasedonCommon

TranscriptomeandMendelian

RandomizationAnalysis

12221*

ZhichaoWang,MengzhenQiu,XinghuaGao,XiangqinGao,LongyangZhang

*通讯作者。

文章引用:王智超,仇梦真,高兴华,高相芹,张龙洋.基于普通转录组和孟德尔随机分析探讨肾透明细胞癌中

PANoptosis相关基因的诊断价值[J].临床医学进展,2024,14(4):156-173.DOI:10.12677/acm.2024.1441001

王智超等

1

DepartmentofUrology,JinanCentralHospital,ShandongUniversity,JinanShandong

2

DepartmentofUrology,CentralHospitalAffiliatedtoShandongFirstMedicalUniversity,JinanShandong

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