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山西2025自考[智能分子工程]分子模拟与计算考前冲刺练习题

一、单项选择题（每题1分，共20分）

1.在分子动力学模拟中，选择合适的时间步长的主要依据是（）。

A.系统的温度

B.系统的压强

C.傅里叶变换的频率

D.隔离体的尺寸

2.分子力场中，Lennard-Jones势能函数适用于描述（）。

A.共价键的相互作用

B.离子键的相互作用

C.分子间范德华力

D.静电相互作用

3.在蒙特卡洛模拟中，重要性抽样方法的主要目的是（）。

A.提高模拟效率

B.减少模拟误差

C.改善系统平衡

D.增强系统稳定性

4.分子动力学模拟中，温度的控速能够通过（）。

A.Nosé-Hoover系统实现

B.Berendsen系统实现

C.VelocityVerlet算法实现

D.Leapfrog算法实现

5.分子力场中，键长、键角和二面角的约束通常用于（）。

A.描述非键相互作用

B.维持分子结构的合理性

C.提高计算精度

D.降低模拟时间

6.在分子对接中，常用的评分函数是（）。

A.MMFF94

B.GROMOS

C.AutoDock

D.CHARMM

7.分子动力学模拟中，压力的控速能够通过（）。

A.Berendsen系统实现

B.Parrinello-Rahman系统实现

C.Nose-Hoover系统实现

D.Langevin方程实现

8.分子力场中，非键相互作用的截断通常采用（）。

A.简单截断

B.封闭式截断

C.模拟盒截断

D.逐步截断

9.在分子动力学模拟中，能量最小化的目的是（）。

A.消除系统中的动能

B.寻找系统的最低能量构型

C.平衡系统的温度

D.降低系统的熵

10.分子对接中，常用的约束条件是（）。

A.键长约束

B.键角约束

C.范德华约束

D.电荷约束

11.在分子动力学模拟中，截断半径的选择会影响（）。

A.模拟精度

B.模拟效率

C.系统的稳定性

D.以上都是

12.分子力场中，原子类型的定义通常基于（）。

A.原子质量

B.原子电荷

C.原子半径

D.以上都是

13.在分子对接中，构象采样的方法包括（）。

A.随机搜索

B.基于力场的搜索

C.分子动力学

D.以上都是

14.分子动力学模拟中，周期性边界条件的作用是（）。

A.模拟无限大系统

B.减少边界效应

C.提高计算精度

D.以上都是

15.分子力场中，力常数通常用于描述（）。

A.键的伸缩性

B.键角的弯曲性

C.二面角的扭转性

D.以上都是

16.在分子动力学模拟中，温度的控速能够通过（）。

A.Nosé-Hoover系统实现

B.Berendsen系统实现

C.VelocityVerlet算法实现

D.Leapfrog算法实现

17.分子对接中，常用的评分函数是（）。

A.MMFF94

B.GROMOS

C.AutoDock

D.CHARMM

18.分子动力学模拟中，压力的控速能够通过（）。

A.Berendsen系统实现

B.Parrinello-Rahman系统实现

C.Nose-Hoover系统实现

D.Langevin方程实现

19.分子力场中，非键相互作用的截断通常采用（）。

A.简单截断

B.封闭式截断

C.模拟盒截断

D.逐步截断

20.在分子动力学模拟中，能量最小化的目的是（）。

A.消除系统中的动能

B.寻找系统的最低能量构型

C.平衡系统的温度

D.降低系统的熵

二、多项选择题（每题2分，共10分）

1.分子动力学模拟中，常用的温度控速方法包括（）。

A.Nosé-Hoover系统

B.Berendsen系统

C.VelocityVerlet算法

D.Langevin方程

E.Parrinello-Rahman系统

2.分子力场中，非键相互作用的描述通常包括（）。

A.Lennard-Jones势能

B.Coulomb势能

C.Morse势能

D.Born-Mayer势能

E.Rydberg势能

3.在分子对接中，常用的评分函数包括（）。

A.AutoDock

B.GROMOS

C.MMFF94

D.CHARMM

E.DOCK

4.分子动力学模拟中，常用的截断方法包括（）。

A.简单截断

B.封闭式截断

C.模拟盒截断

D.逐步截断

E.温度截断

5.分子对接中，常用的约束条件包括（）。

A.键长约束

B.键角约束

C.范德华约束

D.电荷约束

E.构象约束