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化学结构绘图第1页，共39页，星期日，2025年，2月5日1.利用2D优化画环形的氨基酸例111.由模板窗口(TemplateWindows)选择氨基酸(AminoAcids)。2.在氨基酸系列中，选择酪氨酸(Tyrosine)，点击工作区复制结构。3.由化学基团表(TableofRadicals)中选择丙氨酸(Alanine)和色氨酸(Tryptophan)，点击指定的原子，连接上相应的功能团。注意：在固定基团前，可通过按TAB键翻转原子团。第2页，共39页，星期日，2025年，2月5日4.如下图所示从NH2拖动鼠标至OH功能团。5.点击清理键，并或把羟基双键旋转为垂直，得到所需结构。第3页，共39页，星期日，2025年，2月5日2.利用3D优化例12创建双[2，2，2]环己烷结构1.从选择菜单Options/Preferences,在Structure标签下，去掉AddHydrogens前面的对号,点击OK。2.由化学基团表中选取环己烷结构(Cyclohexane)，点击工作区，得到环己烷结构。4.点击正常画图工具(DrawNormal)，通过拖动画出如下的碳氢桥：5.点击3D优化键(3D-optimize)，得到优化后的3D模型。注意：如果工作区中有多个结构，先利用选择工具选取将进行3D优化的结构(可以利用选择/移动、选择/移动/调整、3D旋转工具、套索工具）第4页，共39页，星期日，2025年，2月5日6.如果Options/Preferences/Structure/Switchto3DRotationmode被选中,3D优化后将自动转为3D旋转状态。如果Switchto3DRotationmode没有被选中,点击3D旋转键后,将游标放置在结构式的任何原子或者化学键上,拖动鼠标旋转结构直到得到所需结构。注意:1.从Options/Preferences,在Structure标签下，可以选择背景键断开或者连接,如果在BondsIntersections中的Enable被选中,则背景键断开,否则,背景键连接。2.改变交叉键的位置：选择要改变的键，Tools/BringBondtoFront或SendBondtoBack.也可以通过激活ChangePosition键后,单击即将改变位置的化学键,同时按住SHIFT键将后面的键移到前面来。第5页，共39页，星期日，2025年，2月5日例13.创建三将军结构1.按照上例先画出2.由原子基团表中选择苯环,将光标放在a、b和c键上分别点击，连接上苯环。得到如下结构：3.如果工作区中有多个结构，先选择进行3D优化的结构，点击3D优化键进行优化，并进行3D旋转。4.使用改变位置键改变双键的位置，即可得到所需结构。第6页，共39页，星期日，2025年，2月5日例14画如下结构1.由基团表中选择环丁烷，在工作区点击两次，生成上下两个正方形。2.选择正常画图模式，通过从一个原子到另一个原子拖动鼠标，连接环丁烷分子的角。

3.选中上述结构，点击3D优化键，得到所要的3D模型。4.进行3D旋转，将鼠标放置在任意原子或键上，在工作区拖动鼠标旋转结构，得到所需要的结构。（注意交叉键为不断开，要创建新的一页绘制该结构，因例12、13均为断开）第7页，共39页，星期日，2025年，2月5日3.画化学反应式例151.从原子团表中选择苯环,按键盘上的TAB键,将悬在光标上的苯环翻转,然后在空白区点击,得到苯环,然后在苯环上的相应的位置点击,得到以下结构:

2.再绘制一个苯环，点击右键去掉阴影，点击常规画图工具,然后在苯环的双键上点击,得到三键.

第8页，共39页，星期日，2025年，2月5日3.按照上面所讲的画出三将军结构如下:

4.从结构工具栏中,选择键,在前面两个结构之间点击,得到加号。

5.点击反应箭头键,在反应物和生成物之间点击并拖动鼠标,得到箭头。

注意:1.点击键右下脚的三角,可以得到一系列的不同形状的箭头。一些箭头被视为图形模式的物体,所以不能正确地输出至其他文件。2.如果要移动加号或者箭头,可以点击选择/移动键Select/Move