生物学视角驱动的单细胞基础模型基准研究.pdf

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研究背景

近年来,单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术的发展极大地拓宽了我们对生物学过程和疾病机制的

理解。随着高通量测序技术的进步,单细胞转录组数据量呈指数级增长,但其固有的高维、稀疏和

低信噪比等特点,给传统机器学习模型的应用带来了挑战。受自然语言处理(NLP)领域基座模型

成功的启发,基于Transformer架构的单细胞基础模型(scFMs)应运而生,旨在通过大规模预训练

来学习通用的生物学知识,有望在多种下游任务中实现零样本或少样本的高效迁移。然而,scFMs

是否能够超越标准方法提取独特

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