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植物类群遗传系统进化研究方法比较

目录

内容概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

植物类群遗传系统进化研究方法概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

2.1基因组学方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

2.1.1基因测序技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

2.1.2微阵列技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

2.1.3RNA测序技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

2.2蛋白质组学方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

2.2.1蛋白质质量分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

2.2.2蛋白质相互作用分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

2.3转录组学方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

2.3.1mRNA表达谱．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

2.3.2基因芯片技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

2.4免疫组学方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

2.4.1免疫荧光技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

2.4.2测序方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

不同方法的比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

3.1数据来源与处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

3.1.1数据收集．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

3.1.2数据预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

3.2方法优势．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

3.2.1基因组学方法的优势．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

3.2.2蛋白质组学方法的优势．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49

3.2.3转录组学方法的优势．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．50

3.2.4免疫组学方法的优势．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52

3.3方法局限性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．55

3.3.1基因组学方法的局限性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．56

3.3.2蛋白质组学方法的局限性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．59

3.3.3转录组学方法的局限性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．62

3.3.4免疫组学方法的局限性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．67

3.4方法组合应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．68

3.4.1基因组学与蛋白质组学的结合．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．73

3.4.2转录组学与蛋白质组学的结合．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．74

研究案例．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．76

4.1蔬菜类群遗传系统进化研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．78

4.1.1基因组学研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．80

4.1.2蛋白质组学研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．83

4.1.3转录组学研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．85

4.1.4免疫组学研究方