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基因数据解读师考试试卷
一、单项选择题(共10题,每题1分,共10分)
以下哪种测序技术以长读长为主要特点?
illumina边合成边测序
PacBio单分子实时测序(SMRT)
IonTorrent半导体测序
纳米孔测序(OxfordNanopore)
答案:B
解析:PacBioSMRT技术通过零模波导孔(ZMW)实现单分子测序,读长可达数万碱基,是典型长读长技术;纳米孔测序(D)虽也为长读长,但属于第三代测序的另一分支;illumina(A)和IonTorrent(C)均为短读长的二代测序技术。
根据ACMG变异分类标准,以下哪项属于“致病性变异”的关键证据?
群体数据库中变异频率>1%
多个独立家系中变异与疾病共分离
生物信息学预测软件提示“可能良性”
功能研究显示变异不影响蛋白功能
答案:B
解析:ACMG标准中,“与疾病共分离”(B)是强致病性证据(PS1);群体频率高(A)提示良性(BS1);预测软件提示良性(C)和功能无影响(D)均属于良性证据(BP4、BS3)。
以下哪个数据库主要用于存储人类基因组变异的临床意义?
dbSNP
gnomAD
ClinVar
1000GenomesProject
答案:C
解析:ClinVar(C)是NCBI维护的变异临床意义数据库;dbSNP(A)存储已知SNP的位置信息;gnomAD(B)和1000Genomes(D)是群体频率数据库。
基因数据质量控制中,“测序深度”通常指:
目标区域覆盖的碱基比例
每个碱基被测序的平均次数
测序原始数据中Q30碱基的比例
比对到参考基因组的reads比例
答案:B
解析:测序深度(B)定义为每个碱基被测序的平均次数;覆盖度(A)是目标区域被覆盖的比例;Q30(C)是碱基质量指标;比对率(D)是数据比对效率指标。
连锁分析主要用于以下哪种场景?
确定肿瘤体细胞变异的克隆性
定位孟德尔遗传病的致病基因
分析基因表达量的差异
评估拷贝数变异(CNV)的致病性
答案:B
解析:连锁分析通过家系中标记位点与疾病表型的共分离,定位致病基因(B);肿瘤克隆性分析(A)需单细胞测序或系统发育树;基因表达差异(C)用RNA-seq;CNV致病性(D)需结合频率和功能证据。
转录组数据(RNA-seq)中,“FPKM”指标用于衡量:
可变剪切事件的数量
基因表达量的标准化值
测序数据的比对效率
单核苷酸变异的检出率
答案:B
解析:FPKM(每百万映射reads中每千碱基的碎片数)是RNA-seq中标准化基因表达量的常用指标(B);可变剪切(A)用junctionreads分析;比对效率(C)用比对率;SNP检出率(D)用覆盖度和深度。
以下哪项不符合孟德尔显性遗传的特征?
患者通常为杂合子
男女发病概率均等
连续多代出现患者
携带者(未患病)可将变异传递给子代
答案:D
解析:显性遗传病中,杂合子即可发病,因此携带者(未患病)通常不存在(D错误);显性遗传特征包括杂合发病(A)、男女均等(B)、连续传递(C)。
以下哪种技术最适合检测大段拷贝数变异(CNV,>50kb)?
全外显子测序(WES)
核型分析(Karyotyping)
一代Sanger测序
靶向扩增子测序
答案:B
解析:核型分析(B)通过染色体显带技术可检测>5Mb的CNV;WES(A)适合小片段(<50kb);Sanger(C)和扩增子测序(D)仅检测单基因或小区域。
全基因组关联分析(GWAS)的主要目的是:
鉴定与复杂性状关联的遗传变异
确定单基因病的致病突变
分析肿瘤体细胞突变的驱动基因
评估线粒体DNA变异的母系传递
答案:A
解析:GWAS通过大规模样本关联分析,寻找与复杂疾病/性状相关的SNP(A);单基因病(B)用家系分析;肿瘤驱动基因(C)用突变频率和功能富集;线粒体传递(D)用家系追踪。
线粒体DNA变异的主要遗传特点是:
遵循孟德尔分离定律
仅通过父亲传递给子代
存在异质性(Heteroplasmy)
变异多为染色体数目异常
答案:C
解析:线粒体DNA(mtDNA)因母系遗传(B错误)、无减数分裂(A错误),常存在同一细胞中野生型与突变型mtDNA共存的异质性(C正确);mtDNA变异多为点突变或小缺失(D错误)。
二、多项选择题(共10题,每题2分,共20分)
全外显子测序(WES)的主要特点包括:
覆盖全基因组约1-2%的区域
适合检测大段染色体结构变异
聚焦编码区变异(约85%已知致病变异)
测序成本显著低于全基因组测序(WGS)
答案:ACD
解析:WES覆盖外显子(约1-2%基因组,A正确),聚焦编码区(C正确),成本低于WGS(D正确);但无法检测大段
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