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基因工程的载体和工具酶;引言;Characteristicsofvectorsforgenecloning;一、质粒载体
(plasimidvectors);(一)质粒的生物学特性;(一)质粒的生物学特性;(一)质粒的生物学特性;(一)质粒的生物学特性;(一)质粒的生物学特性;(二)质粒DNA的制备;碱变性法质粒提取的原理:
根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA片断之间,在拓扑学上的差异而发展出来的。
在pH值12.0~12.5范围内时,线性的DNA会被变性而共价闭合环状质粒DNA却不会被变性。
通过冷却或恢复中性pH值使之复性,线性染色体形成网状结构,而cccDNA可以准确迅速复性,通过离心去除线性染色体,获得含有cccDNA的上清液,最后用乙醇沉淀,获得质粒DNA。;碱变性法提取质粒的步骤:
1、取1.5毫升含质粒的大肠杆菌过夜培养物,加在微量离心管中,离心收集细胞沉淀;
2、加入100微升冰冷的溶液I,(50mM葡萄糖,25mMTris-HClPH=8.0,10mMEDTA)涡旋震荡悬浮菌液。
3、加入200微升新配制的溶液II,(0.2MNaOH,1.0%SDS)缓缓混匀置室温5分钟。
4、加入150毫升冰冷的溶液III,(醋酸钾29.4克,冰乙酸11.5毫升,加蒸馏水至100毫升)颠倒离心管10次后,冰浴5分钟。
5、离心的上清液用苯酚抽提数次,用乙醇沉淀收集质粒DNA。;(三)质粒载体的改造;1、质粒pBR322;pBR322质粒的优点:
(1)具有较小的分子量。
4363bp,2.6×106Da,
(2)具有两种抗菌素抗性基因可供作转化子的选择记号。
(3)具较高的拷贝数,而且经过氯霉素扩增之后,每个细胞中可累积1000~3000个拷贝。
(4)对多种常见的限制性内切核酸酶只含有一个能切割的位点。;;2、pUC质粒载体;2、pUC质粒载体;?-互补(alpha-complementation)
大肠杆菌?-半乳糖苷酶可以和其底物X-Gal相互作用并且释放出一种蓝色物质,当该酶的?-片段和?-片段分开时就失去了这种显色的功能。通常将编码该酶?-片段的LacZ’基因插入到载体的多克隆位点的侧翼序列中,而在一些人工构建的大肠杆菌株系中却只能编码产生该酶的?片段。这样一来,含有功能性完整的LacZ’基因的载体导入到这类寄主细胞中时,载体编码的?-片段就能和寄主编码的?片段发生互补并具有了对底物X-gal的作用功能(发生显色反应),这种现象被成为是alpha-complementation.
X-Gal:5-溴-4-氯-3-吲哚-β-D-半乳糖苷;;二、噬菌体载体
(phagevectors);1.噬菌体的生物学特性;1.噬菌体的生物学特性;2.?噬菌体的生物学特性;2.?噬菌体的生物学特性;2.?噬菌体的生物学特性;;①Insertionvectors;②Replacementvectors;(二)M13噬菌体;;2.M13噬菌体载体的构建;(三)柯斯质粒载体(cosmidvectors);(三)柯斯质粒载体(cosmidvectors);(三)柯斯质粒载体(cosmidvectors);;第二节基因操作的工具酶;(一)限制性核酸内切酶的发现
(二)限制性核酸内切酶的分类
(三)限制性核酸内切酶的命名
(四)II型限制性核酸内切酶的基本特性
(五)限制性核酸内切酶的消化反应;⑶具备多克隆位点(MCS),便于外源基因插入。
5’TTTTTTTTT
3’XXXXCCTAGGXXXXXX5’
是两条链-因此不能将两条单链连接起来或使单链环化起来。
2、加入100微升冰冷的溶液I,(50mM葡萄糖,25mMTris-HClPH=8.
这是该噬菌体能用于单链DNA载体的重要前提。
(2)四环素抗性基因(tetr或Tcr)
利用其5′--3′的外切酶活性及其聚合酶活性。
碱变性法质粒提取的原理:
⑶cDNA克隆中第二链cDNA的合成
3’XXXXTCTAGGXXXXXX5’
(1)具有更小的分子量和更高的拷贝数;E.coliB含有EcoB核酸酶和EcoB甲基化酶
当λ(k)噬菌体侵染E.coliB时,由于其DNA中有EcoB核酸酶特异识别的碱基序列,被降解掉。而E.coliB的DNA中虽然也存在这种特异序列,但可在EcoB甲基化酶的作用下,催化S-腺苷甲硫氨酸(SAM)将甲基转移给限制酶识别序列的特定碱基,使之甲基化。EcoB核酸酶不能识别已甲基化的序列。;;最早分离出的限制内切酶—1968年,Mes
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