2025年大学《生物信息学》专业题库—— 水生生物多样性与生态系统功能关系研究.docxVIP

2025年大学《生物信息学》专业题库——水生生物多样性与生态系统功能关系研究

考试时间：______分钟总分：______分姓名：______

一、单选题（每题2分，共20分）

1.下列哪个数据库主要收录了全球范围内的水生生物物种分类学信息？

A.NCBIGenBank

B.UniProt

C.GlobalBiodiversityInformationFacility(GBIF)

D.Ensembl

2.在水生生物多样性与生态系统功能关系研究中，常用的群落结构分析方法不包括？

A.瑞文指数（RVegan）

B.系统发育树构建

C.多元统计分析（如PCA、CCA）

D.基因表达谱分析

3.以下哪种测序技术通常用于获取环境样品中所有生物的遗传物质信息？

A.Sanger测序

B.Illumina测序

C.Pyrosequencing

D.454测序

4.用于评估群落相似性的指标中，Jaccard指数和S?rensen指数都属于？

A.距离系数

B.相似性系数

C.离散度指数

D.丰度指数

5.在生物信息学分析中，用于对基因表达数据进行标准化处理的方法不包括？

A.基于秩的方法（如RMA）

B.总RNA校正

C.基于方差的方法（如VSN）

D.T测试

6.以下哪个软件包主要用于生物序列的比对和编辑？

A.R

B.Python

C.BLAST

D.MATLAB

7.在水生生态系统功能研究中，稳定性的一个重要指标是？

A.物种丰富度

B.功能多样性

C.生态位宽度

D.频率稳定性

8.以下哪种算法不属于机器学习范畴？

A.决策树

B.支持向量机

C.主成分分析

D.K均值聚类

9.用于构建物种分布模型的重要环境变量不包括？

A.温度

B.水深

C.种类

D.降水

10.生物信息学在揭示水生生物与环境互作机制方面的一个重要应用是？

A.物种鉴定

B.群落构建

C.基因功能预测

D.数据库建立

二、简答题（每题4分，共20分）

1.简述高通量测序技术在水生生物多样性研究中的应用及其优势。

2.解释什么是生物信息学中的“功能预测”，并列举至少三种功能预测的方法。

3.简述冗余分析（RDA）在水生生态系统功能研究中的作用。

4.描述系统发育树在比较不同水生生物类群生态位宽度时的应用。

5.简述生物信息学在水生生态系统恢复力研究中的应用。

三、数据分析题（共30分）

假设你获得了一份某湖泊不同功能群（浮游植物、浮游动物、底栖生物）的16SrRNA基因测序数据（丰度表，提供），以及该湖泊的水质参数数据（提供）。请运用生物信息学方法分析该湖泊的群落结构特征，并探讨群落结构与水质参数之间的关系。要求说明你将采用的分析方法、使用的软件或工具，并简述分析步骤和结果解释思路。

四、综合应用题（共25分）

设计一个研究方案，利用生物信息学方法探究某河口区域盐度变化对底栖微生物群落结构和功能的影响。要求详细说明研究目标、数据收集策略（包括数据类型、来源等）、数据处理和分析方法、以及预期结果和潜在应用价值。

五、论述题（共5分）

讨论生物信息学在水生生物多样性与生态系统功能关系研究中的局限性和未来发展趋势。

试卷答案

一、单选题

1.C

2.D

3.C

4.B

5.D

6.C

7.D

8.C

9.C

10.C

二、简答题

1.高通量测序技术可以快速、高通量地获取水生生物的遗传信息，用于构建物种库、分析群落结构、研究遗传多样性等。其优势在于能够处理海量数据，发现传统方法难以检测到的低丰度物种，并提供更精细的群落组成信息。

2.功能预测是指利用生物序列信息、系统发育关系或其他数据，推断基因、物种或群落的功能特性。方法包括：基于序列相似性的比对（如BLAST）、基于系统发育的推断、基于基因表达谱的分析（如GO富集分析）、基于蛋白质结构域的分析等。

3.RDA是一种基于冗余分析的多元统计方法，用于探究环境因子与物种群落结构之间的关系。它可以将环境因子和物种群落数据同时进行主成分分析，识别出对群落结构影响最大的环境梯度，并评估环境因子对群落变量的解释程度。

4.系统发育树可以展示不同水生生物类群之间的进化关系，结合生态位宽度分析，可以比较不同类群在生态位上的分化程度。通过构建包含