NetPath:校正人类信号传导通路数据库简介.pdfVIP

NetPath:校正人类信号传导通路数据库简介.pdf

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#数据库#NetPath一个校正的人类信号传导通路数据库

Peaker

,蛋白,代谢物等生物分子与生物学通路之间的关系越来越

多的得到重视,由于本身对于外界环境刺激过于敏感,因此我们

往往需要从功能层面进行分析,从而增加结论的稳定性。因此,NetPath

的开发团队才对和通路之间的相关性进行人工校正,从而为生物

学家们一个的可信的功能通路信息。

NetPath主页

在NetPath主页中,我们可以看到右侧statistics,统计了数据库中收录

的通路和分子情况。包括校正的通路36个,涉及到的分子1053个,

存在互作2448个,转录调控关系7401,蛋白284个,酶

水解1597个。左侧为检索界面,用户可以有四种检索方式,分别是基

因symbol,蛋白名,accessionnumber,通路名等。点击submit提交进

行检索。

#database#NetPathAcalibratedhumansignalingpathwaydatabase

Peaker

Therelationshipweengenes,proteins,metabolitesandother

biomolecuandbiologicalpathwayshasreceivedmoreandmore

attention.Sincegenesthemselvesaretoosensitivetoexternal

environmentalstimuli,weoftenneedtoanalyzethemfromthe

functionalleveltoincreasethestabilityoftheconclusions.

Therefore,theNetPathdevelopmentteammanuallycorrectedthe

correlationweengenesandpathwaystoprovidebiologistswith

authoritativeandcrediblefunctionalpathwayinformation.

NetPathhomepage

IntheNetPathhomepage,wecanseethestatisticsontheright,

whichstatisticsthepathwaysandmolecuincludedinthe

database.Itincludes36correctedpathways,1053molecui

nvolved,2448physicalinteractions,7401genetranscription

regulatoryrelationships,284transportproteins,and1597enzyme

hydrolysis.Theleftsideisthesearchinterface.Userscanhavefour

searchmethods,namelygenesymbol,proteinname,accession

number,pathwayname,etc.Clicksubmittosubmitforretrieval.

我们以EGFR为例,点击提交后可以跳转到结果页面,如上图所

示,包括蛋白名,symbol名,以及其他同义名alternatenames。最上方

可以看到EGFR在细胞膜上的结构信息,点击后可以跳转到下面界面。

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