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再生医学转录组学工程师岗位考试试卷及答案

一、单项选择题(每题2分,共10题)

1.转录组学研究的主要对象是()

A.DNAB.RNAC.蛋白质D.多糖

2.以下哪种技术常用于转录组测序()

A.SouthernblotB.WesternblotC.RNA-seqD.PCR

3.基因表达水平的衡量指标通常是()

A.基因长度B.转录本数量C.外显子数量D.内含子数量

4.用于分析转录组数据差异表达基因的软件是()

A.PhotoshopB.R语言C.WordD.Excel

5.转录起始位点通常位于()

A.基因上游B.基因中间C.基因下游D.不一定

6.非编码RNA中,参与调控基因表达的是()

A.tRNAB.rRNAC.miRNAD.mRNA

7.构建转录组文库时,首先要进行的步骤是()

A.片段化B.反转录C.加接头D.测序

8.转录组数据质量评估不包括()

A.测序深度B.碱基质量C.基因功能D.比对率

9.以下哪种情况可能导致基因表达上调()

A.启动子甲基化B.增强子活性增强C.组蛋白去乙酰化D.转录因子缺失

10.转录组分析中,将测序reads比对到参考基因组的工具是()

A.BLASTB.BowtieC.SPSSD.SAS

二、多项选择题(每题2分,共10题)

1.转录组学研究的应用领域包括()

A.疾病诊断B.药物研发C.植物育种D.进化研究

2.转录组测序的优点有()

A.可发现新转录本B.定量准确C.能检测基因结构变异D.无需预先知道序列信息

3.影响基因表达的因素有()

A.环境因素B.转录因子C.染色质结构D.基因拷贝数

4.以下属于转录组数据分析流程的有()

A.数据清洗B.比对C.差异表达分析D.功能注释

5.常用的转录组数据可视化工具包括()

A.ggplot2B.CircosC.Excel图表D.DAVID

6.非编码RNA包括()

A.lncRNAB.circRNAC.snoRNAD.snRNA

7.转录组文库构建过程涉及的步骤有()

A.RNA提取B.cDNA合成C.文库扩增D.片段筛选

8.转录组学研究中样本选择的原则有()

A.代表性B.重复性C.随机性D.稳定性

9.差异表达基因的功能富集分析可使用的数据库有()

A.GOB.KEGGC.Swiss-ProtD.Pfam

10.转录组学与蛋白质组学的关联在于()

A.转录水平影响蛋白表达B.两者可相互验证C.都研究基因功能D.分析方法相同

三、判断题(每题2分,共10题)

1.转录组是指某一物种基因组中所有基因转录产物的集合。()

2.RNA-seq只能检测已知基因的表达。()

3.基因表达水平在不同组织和发育阶段是相同的。()

4.转录组数据分析可以直接确定基因的功能。()

5.构建转录组文库时,RNA质量对结果影响不大。()

6.所有的转录本都能翻译成蛋白质。()

7.差异表达分析能找出在不同条件下表达有显著变化的基因。()

8.功能富集分析是为了确定基因在细胞内的具体位置。()

9.转录组学研究不需要设置生物学重复。()

10.转录因子通过与DNA结合来调控基因转录。()

四、简答题(每题5分,共4题)

1.简述转录组学在疾病诊断中的应用原理。

通过比较疾病样本和正常样本的转录组,找出差异表达基因,这些基因可作为疾病诊断的生物标志物,其表达变化能反映疾病的发生、发展及状态。

2.转录组数据分析中,为什么要进行数据标准化?

不同样本的测序深度等存在差异,标准化可消除这些技术差异,使不同样本间基因表达量具有可比性,保证后续分析如差异表达分析结果的准确性。

3.简述非编码RNA调控基因表达的主要方式。

可通过与mRNA互补配对影响其稳定性、翻译过程;或与蛋白质相互作用,招募相关复合物调控转录;还可参与染色质修饰,影响基因可及性来调控表达。

4.构建转录组文库的关键步骤有哪些?

关键步骤包括高质量RNA提取,保证RNA的完整性和纯度;反转录合成cDNA,将RNA转变为cDNA便于后续操作;以及合适的片段筛选和文库扩增,确保文库质量和代表性。

五、讨论题(每题5分,共4题)

1.讨论转录组学与精准医学的关系。

转录组学可发现疾病相关的分子特征,为疾病精准分类和诊断提供依据。通过分析患者转录组,能找到个性化治疗靶点,实现精准用药,提高治疗效果,推动精准医学发展。

2.谈谈转录组学技术在植物抗逆研究中的应用前景。

可用于解析植物在逆境下基因表达调控机制,找到关键抗逆基因。有助于培育抗逆新品种,提高作物产量和品质,在农业生产应对气候变化等方面有广阔应用前景。

3.如何解决转录组数据分析中的假阳性问题?

设置合理的差异表达分析阈值,增加生物学重复提高数据可靠性,结合多组学数据相互验证,对结果进行严格的统计检验和功能验证,减少假阳性结果干扰。

4.讨

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